RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539477.5

MLH1-222, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2 BASIC

Gene MLH1, Length 2,366 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-222	ENST00000539477	TFF2	Q03403	129 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MLH1-222	ENST00000539477	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
MLH1-222	ENST00000539477	PPP3CA	Q08209	521 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MLH1-222	ENST00000539477	STIM1	Q13586	685 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MLH1-222	ENST00000539477	CLUL1	Q15846	466 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MLH1-222	ENST00000539477	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
MLH1-222	ENST00000539477	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MLH1-222	ENST00000539477	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MLH1-222	ENST00000539477	GPR153	Q6NV75	609 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MLH1-222	ENST00000539477	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
MLH1-222	ENST00000539477	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MLH1-222	ENST00000539477	CXorf38	Q8TB03	319 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MLH1-222	ENST00000539477	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
MLH1-222	ENST00000539477	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MLH1-222	ENST00000539477	APOL5	Q9BWW9	433 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MLH1-222	ENST00000539477	PLVAP	Q9BX97	442 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MLH1-222	ENST00000539477	ASB7	Q9H672	318 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MLH1-222	ENST00000539477	INTS13	Q9NVM9	706 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MLH1-222	ENST00000539477	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MLH1-222	ENST00000539477	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MLH1-222	ENST00000539477	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MLH1-222	ENST00000539477	PTPRD	P23468	1912 aa		10.02	□□□□□ -0.8
MLH1-222	ENST00000539477	LILRA4	P59901	499 aa		10.02	□□□□□ -0.8
MLH1-222	ENST00000539477	PLCB3	Q01970	1234 aa		10.02	□□□□□ -0.8
MLH1-222	ENST00000539477	KRT17	Q04695	432 aa		10.02	□□□□□ -0.8
MLH1-222	ENST00000539477	BIRC3	Q13489	604 aa		10.02	□□□□□ -0.8
MLH1-222	ENST00000539477	PTPN14	Q15678	1187 aa		10.02	□□□□□ -0.8
MLH1-222	ENST00000539477	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		10.02	□□□□□ -0.8
MLH1-222	ENST00000539477	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		10.02	□□□□□ -0.8
MLH1-222	ENST00000539477	BEST2	Q8NFU1	509 aa		10.02	□□□□□ -0.8
MLH1-222	ENST00000539477	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.8
MLH1-222	ENST00000539477	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		10.02	□□□□□ -0.8
MLH1-222	ENST00000539477	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.8
MLH1-222	ENST00000539477	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		10.02	□□□□□ -0.8
MLH1-222	ENST00000539477	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.8
MLH1-222	ENST00000539477	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		10.02	□□□□□ -0.8
MLH1-222	ENST00000539477	C2CD2	Q9Y426	696 aa		10.02	□□□□□ -0.8
MLH1-222	ENST00000539477	NOTCH4	Q99466	2003 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	10.02	□□□□□ -0.81	6e-11	■■■■■ 91.9
MLH1-222	ENST00000539477	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	KIF20A	O95235	890 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	IL18RAP	O95256	599 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	RB1	P06400	928 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	OR4Q2	P0C623	313 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	NLRP12	P59046	1061 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	BFSP1	Q12934	665 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	PSMD6	Q15008	389 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	CBWD6	Q4V339	395 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	SAMD11	Q96NU1	681 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	CGRRF1	Q99675	332 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	FRYL	O94915	3013 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	EFEMP2	O95967	443 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	SOD2	P04179	222 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	UROD	P06132	367 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	VAMP7	P51809	220 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	LRRC63	Q05C16	580 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	TYRO3	Q06418	890 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	HYAL1	Q12794	435 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	BORCS6	Q96GS4	357 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	TMEM209	Q96SK2	561 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	TSG101	Q99816	390 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	ANO9	A1A5B4	782 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	PIR	O00625	290 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	CETN3	O15182	167 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	TEX28	O15482	410 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	VNN1	O95497	513 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	CXCL14	O95715	111 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	GLP2R	O95838	553 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	LRPAP1	P30533	357 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	RAP1GAP	P47736	663 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	ARPP19	P56211	112 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	MYL6	P60660	151 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	KYAT1	Q16773	422 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	PTPN21	Q16825	1174 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MLH1-222	ENST00000539477	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		10.01	□□□□□ -0.81

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