RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa5.1□□□□□ -1.59
HDAC2-216ENST00000523628 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa5.1□□□□□ -1.59
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HDAC2-216ENST00000523628 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
HDAC2-216ENST00000523628 GSTA4O15217 222 aa5.09□□□□□ -1.59
HDAC2-216ENST00000523628 ZEB2O60315 1214 aa5.09□□□□□ -1.59
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HDAC2-216ENST00000523628 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
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HDAC2-216ENST00000523628 MMEP08473 750 aa5.08□□□□□ -1.6
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HDAC2-216ENST00000523628 ERO1BQ86YB8 467 aa5.08□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 ERC1Q8IUD2 1116 aa5.08□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 FAM9BQ8IZU0 186 aa5.08□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 CNTD1Q8N815 330 aa5.08□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa5.08□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 MBD6Q96DN6 1003 aa5.08□□□□□ -1.6
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HDAC2-216ENST00000523628 HOMER2Q9NSB8 354 aa5.08□□□□□ -1.6
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HDAC2-216ENST00000523628 COL4A1P02462 1669 aa5.08□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 TNKSO95271 1327 aa5.07□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa5.07□□□□□ -1.6
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HDAC2-216ENST00000523628 TMEM132BQ14DG7 1078 aa5.07□□□□□ -1.6
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HDAC2-216ENST00000523628 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 Q8N1X5 172 aa5.07□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 FAM151AQ8WW52 585 aa5.07□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 ASB15Q8WXK1 588 aa5.07□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 SLC5A5Q92911 643 aa5.07□□□□□ -1.6
HDAC2-216ENST00000523628 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
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