RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522344.1

CPEB4-210, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene CPEB4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB4-210ENST00000522344 C11orf21Q9P2W6 132 aa5.57□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 PACSIN3Q9UKS6 424 aa5.57□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 CDYLQ9Y232 598 aa5.57□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 COL4A3Q01955 1670 aa5.56□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 PIPSLA2A3N6 862 aa5.56□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 FCER1AP12319 257 aa5.56□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 AVPR1BP47901 424 aa5.56□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 IGBP1P78318 339 aa5.56□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 TLE1Q04724 770 aa5.56□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 FAM43AQ8N2R8 423 aa5.56□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 SLC44A3Q8N4M1 653 aa5.56□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 CHMP4CQ96CF2 233 aa5.56□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 TLR10Q9BXR5 811 aa5.56□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 GALNT9Q9HCQ5 603 aa5.56□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa5.56□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 HSFX1Q9UBD0 423 aa5.56□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 KCNE5Q9UJ90 142 aa5.56□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 LRRC14BA6NHZ5 514 aa5.55□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 DTNBO60941 627 aa5.55□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 RHOBTB3O94955 611 aa5.55□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 HKR1P10072 659 aa5.55□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 PDCP20941 246 aa5.55□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 SMARCA1P28370 1054 aa5.55□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 NEK2P51955 445 aa5.55□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 SLFN5Q08AF3 891 aa5.55□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 ABHD17BQ5VST6 288 aa5.55□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 CATIPQ7Z7H3 387 aa5.55□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 GPR149Q86SP6 731 aa5.55□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 CPA6Q8N4T0 437 aa5.55□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 IL17RDQ8NFM7 739 aa5.55□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 NACC2Q96BF6 587 aa5.55□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 HSPBAP1Q96EW2 488 aa5.55□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 DMRTA2Q96SC8 542 aa5.55□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 IMPG2Q9BZV3 1241 aa5.55□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 SLAMF7Q9NQ25 335 aa5.55□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 TBCCD1Q9NVR7 557 aa5.55□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 IP6K2Q9UHH9 426 aa5.55□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 SLC45A2Q9UMX9 530 aa5.55□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 MALP21145 153 aa5.54□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 DSC2Q02487 901 aa5.54□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 TAP1Q03518 808 aa5.54□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 SNAPC2Q13487 334 aa5.54□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 CYP2A13Q16696 494 aa5.54□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 GEN1Q17RS7 908 aa5.54□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 FLYWCH1Q4VC44 716 aa5.54□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 AOPEPQ8N6M6 819 aa5.54□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 SLC17A8Q8NDX2 589 aa5.54□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 ZG16BQ96DA0 208 aa5.54□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 BOD1Q96IK1 185 aa5.54□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 Q96MF0 132 aa5.54□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 CASS4Q9NQ75 786 aa5.54□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 JKAMPQ9P055 326 aa5.54□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa5.54□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 SLC43A1O75387 559 aa5.53□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 GNAI3P08754 354 aa5.53□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 BMP5P22003 454 aa5.53□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 FDXRP22570 491 aa5.53□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 PROZP22891 400 aa5.53□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 PLA2G5P39877 138 aa5.53□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 INHBEP58166 350 aa5.53□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 GNAI1P63096 354 aa5.53□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF844Q08AG5 666 aa5.53□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 CCDC157Q569K6 752 aa5.53□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 SLC4A10Q6U841 1118 aa5.53□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 PCSK4Q6UW60 755 aa5.53□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF365Q70YC5 407 aa5.53□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 COLGALT2Q8IYK4 626 aa5.53□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 C3orf20Q8ND61 904 aa5.53□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 TMIEQ8NEW7 156 aa5.53□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 HOOK2Q96ED9 719 aa5.53□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 KLHL32Q96NJ5 620 aa5.53□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 MED15Q96RN5 788 aa5.53□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 TOR3AQ9H497 397 aa5.53□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
CPEB4-210ENST00000522344 TRGV11A0A075B6L2 103 aa5.52□□□□□ -1.53
CPEB4-210ENST00000522344 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa5.52□□□□□ -1.53
CPEB4-210ENST00000522344 OVOL3O00110 214 aa5.52□□□□□ -1.53
CPEB4-210ENST00000522344 F2RL2O00254 374 aa5.52□□□□□ -1.53
CPEB4-210ENST00000522344 ALDH1L1O75891 902 aa5.52□□□□□ -1.53
CPEB4-210ENST00000522344 ZFPL1O95159 310 aa5.52□□□□□ -1.53
CPEB4-210ENST00000522344 FTLP02792 175 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
CPEB4-210ENST00000522344 PF4V1P10720 104 aa5.52□□□□□ -1.53
CPEB4-210ENST00000522344 NCLP19338 710 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
CPEB4-210ENST00000522344 PHKA1P46020 1223 aa5.52□□□□□ -1.53
CPEB4-210ENST00000522344 VAV2P52735 878 aa5.52□□□□□ -1.53
CPEB4-210ENST00000522344 SEC24CP53992 1094 aa5.52□□□□□ -1.53
CPEB4-210ENST00000522344 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
CPEB4-210ENST00000522344 SCAPQ12770 1279 aa5.52□□□□□ -1.53
CPEB4-210ENST00000522344 FOXI1Q12951 378 aa5.52□□□□□ -1.53
CPEB4-210ENST00000522344 CCDC93Q567U6 631 aa5.52□□□□□ -1.53
CPEB4-210ENST00000522344 TMEM240Q5SV17 173 aa5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms