RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497870.1

PLS3-208, Transcript of plastin 3, human

TSL 4

Gene PLS3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PLS3-208	ENST00000497870	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	GPR87	Q9BY21	358 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	LANCL2	Q9NS86	450 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	PADI4	Q9UM07	663 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	ISM1	B1AKI9	464 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	MYB	P10242	640 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	SLC5A1	P13866	664 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	GYPE	P15421	78 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	MAP2K6	P52564	334 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	RAB1A	P62820	205 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	DSC2	Q02487	901 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	ABHD18	Q0P651	414 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	CRHR2	Q13324	411 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	IL10RA	Q13651	578 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	C4orf46	Q504U0	113 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	PCSK4	Q6UW60	755 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	KAT5	Q92993	513 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	ARL8A	Q96BM9	186 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	SUCLG2	Q96I99	432 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	CCDC138	Q96M89	665 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	WDCP	Q9H6R7	721 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	TMEM140	Q9NV12	185 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	NCDN	Q9UBB6	729 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	DMTF1	Q9Y222	760 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870		A0A1W2PPL8	197 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	IL2RB	P14784	551 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	NR4A1	P22736	598 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	GZMK	P49863	264 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	PTTG1IP	P53801	180 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	RABL3	Q5HYI8	236 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	USP51	Q70EK9	711 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	MB21D1	Q8N884	522 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	SLC35A4	Q96G79	324 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	APIP	Q96GX9	242 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	RASA4B	C9J798	803 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870		H3BUI4	141 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	RASA4	O43374	803 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	MFAP3L	O75121	409 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	MYF5	P13349	255 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	GNAT2	P19087	354 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	MCM7	P33993	719 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	DUSP2	Q05923	314 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	SEPT2	Q15019	361 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	PRR16	Q569H4	304 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	PPM1E	Q8WY54	764 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	PHKB	Q93100	1093 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	TMX3	Q96JJ7	454 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	PNPO	Q9NVS9	261 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLS3-208	ENST00000497870	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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