RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491658.1

TFRC-215, Transcript of transferrin receptor, human

TSL 5

Gene TFRC, Length 396 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TFRC-215	ENST00000491658	FSTL1	Q12841	308 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	PRR18	Q8N4B5	295 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	HOOK2	Q96ED9	719 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	RNF31	Q96EP0	1072 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	PNKP	Q96T60	521 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	SYBU	Q9NX95	663 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	JKAMP	Q9P055	326 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	RNF181	Q9P0P0	153 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	DTNB	O60941	627 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	SLC43A1	O75387	559 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	ALDH1L1	O75891	902 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	AGFG2	O95081	481 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	IL33	O95760	270 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	PDGFRB	P09619	1106 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	MAL	P21145	153 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	TGM1	P22735	817 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	COL10A1	Q03692	680 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	SNAPC2	Q13487	334 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	USP45	Q70EL2	814 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	ZNF365	Q70YC5	407 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	GPR149	Q86SP6	731 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	LCORL	Q8N3X6	602 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	NACC2	Q96BF6	587 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	MED15	Q96RN5	788 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	F2RL2	O00254	374 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	ZFPL1	O95159	310 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	POU2F2	P09086	479 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	ITGAM	P11215	1152 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	AVPR1B	P47901	424 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	USP14	P54578	494 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	BLOC1S1	P78537	153 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	CYP2A13	Q16696	494 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658		Q8NA96	180 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	C3orf20	Q8ND61	904 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	COQ10A	Q96MF6	247 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	TLR10	Q9BXR5	811 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	TOR3A	Q9H497	397 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	POLH	Q9Y253	713 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	MYADML2	A6NDP7	307 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	SUV39H1	O43463	412 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	ABLIM3	O94929	683 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	RHOBTB3	O94955	611 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	HKR1	P10072	659 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	VCAM1	P19320	739 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	AKAP5	P24588	427 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	VAV2	P52735	878 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	MCL1	Q07820	350 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	TMIE	Q8NEW7	156 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	RGMA	Q96B86	450 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	CDYL	Q9Y232	598 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	SLC16A6	O15403	523 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	ARIH2	O95376	493 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	PF4V1	P10720	104 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	FDXR	P22570	491 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	HK3	P52790	923 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	SEC24C	P53992	1094 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	NOG	Q13253	232 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TFRC-215	ENST00000491658	GEN1	Q17RS7	908 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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