RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 VPS11Q9H270 941 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRC-212ENST00000491302 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
PTPRC-212ENST00000491302 HDAC5Q9UQL6 1122 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRC-212ENST00000491302 RNF114Q9Y508 228 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRC-212ENST00000491302 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRC-212ENST00000491302 CDC14BO60729 498 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRC-212ENST00000491302 HAUS5O94927 633 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRC-212ENST00000491302 GJB1P08034 283 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRC-212ENST00000491302 RPS19P39019 145 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
PTPRC-212ENST00000491302 PPP2CBP62714 309 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRC-212ENST00000491302 PPP2CAP67775 309 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRC-212ENST00000491302 NOMO3P69849 1222 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRC-212ENST00000491302 C4orf46Q504U0 113 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
PTPRC-212ENST00000491302 ERAP2Q6P179 960 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRC-212ENST00000491302 DOK3Q7L591 496 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRC-212ENST00000491302 FAM83AQ86UY5 434 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRC-212ENST00000491302 SKAP1Q86WV1 359 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRC-212ENST00000491302 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
PTPRC-212ENST00000491302 ZFP28Q8NHY6 868 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
PTPRC-212ENST00000491302 LMF1Q96S06 567 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRC-212ENST00000491302 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
PTPRC-212ENST00000491302 PPCSQ9HAB8 311 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRC-212ENST00000491302 SERHLQ9NQF3 203 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRC-212ENST00000491302 SACM1LQ9NTJ5 587 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRC-212ENST00000491302 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP9.34□□□□□ -0.91
PTPRC-212ENST00000491302 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 BTN3A1O00481 513 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 RARBP10826 455 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 TRAPPC10P48553 1259 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 BMT2Q1RMZ1 405 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 OGFOD2Q6N063 350 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF365Q70YC5 407 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC33Q8N5R6 958 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 SLC35B2Q8TB61 432 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 POF1BQ8WVV4 589 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 DPYSL5Q9BPU6 564 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 HERPUD2Q9BSE4 406 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 BRIP1Q9BX63 1249 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 SRRDQ9UH36 339 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 FGF18O76093 207 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 TSHRP16473 764 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 RAB32Q13637 225 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 UBXN2BQ14CS0 331 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 FKBP15Q5T1M5 1219 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 GPR135Q8IZ08 494 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 SIK2Q9H0K1 926 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 STK32BQ9NY57 414 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 GPRC5BQ9NZH0 403 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 COL20A1Q9P218 1284 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 APOL1O14791 398 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 PAX4O43316 350 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 NCK2O43639 380 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 GNAT2P19087 354 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 PPM1AP35813 382 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 RAP2BP61225 183 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 TNFAIP2Q03169 654 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 SLC13A2Q13183 592 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 NT5DC1Q5TFE4 455 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 ANO1Q5XXA6 986 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 SP8Q8IXZ3 490 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM43BA6NCK2 446 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 PRSS29PA6NIE9 313 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 STC2O76061 302 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 ABHD16AO95870 558 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 ABCB4P21439 1286 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 PHKA1P46020 1223 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 EFCAB12Q6NXP0 572 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 LIX1LQ8IVB5 337 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 RNF152Q8N8N0 203 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 ATP11CQ8NB49 1132 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 TFAP2CQ92754 450 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 ADAM7Q9H2U9 754 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 GSTO2Q9H4Y5 243 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 GPR35Q9HC97 309 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 CEP83Q9Y592 693 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 F8W8V4 182 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 MFAP3LO75121 409 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 IPO13O94829 963 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 CHEK2O96017 543 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 INHBBP09529 407 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 MGAT1P26572 445 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRC-212ENST00000491302 TECP42680 631 aa9.29□□□□□ -0.92
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