RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
STRADBP1-201ENST00000478954 ARFGAP3Q9NP61 516 aa6.72□□□□□ -1.33
STRADBP1-201ENST00000478954 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
STRADBP1-201ENST00000478954 DENND2AQ9ULE3 1009 aa6.72□□□□□ -1.33
STRADBP1-201ENST00000478954 USP18Q9UMW8 372 aa6.72□□□□□ -1.33
STRADBP1-201ENST00000478954 LRCH1Q9Y2L9 728 aa6.72□□□□□ -1.33
STRADBP1-201ENST00000478954 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa6.72□□□□□ -1.33
STRADBP1-201ENST00000478954 LAMA3Q16787 3333 aa6.72□□□□□ -1.33
STRADBP1-201ENST00000478954 LAMB4A4D0S4 1761 aa6.72□□□□□ -1.33
STRADBP1-201ENST00000478954 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa6.71□□□□□ -1.33
STRADBP1-201ENST00000478954 TTC28Q96AY4 2481 aa6.71□□□□□ -1.33
STRADBP1-201ENST00000478954 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 A0A1W2PQJ5 194 aa6.71□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 FAHP16930 419 aa6.71□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM209BQ5JX69 171 aa6.71□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 IZUMO3Q5VZ72 239 aa6.71□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 GAREM2Q75VX8 874 aa6.71□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 TMC6Q7Z403 805 aa6.71□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 MILR1Q7Z6M3 343 aa6.71□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 SAPCD2Q86UD0 394 aa6.71□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 TEX19Q8NA77 164 aa6.71□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 TTLL11Q8NHH1 800 aa6.71□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 FATE1Q969F0 183 aa6.71□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 APIPQ96GX9 242 aa6.71□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 ARMT1Q9H993 441 aa6.71□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 CERS4Q9HA82 394 aa6.71□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 GCM1Q9NP62 436 aa6.71□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa6.71□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 LRRC14BA6NHZ5 514 aa6.7□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 FTLP02792 175 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 CYBBP04839 570 aa6.7□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 COL6A1P12109 1028 aa6.7□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 RAB1AP62820 205 aa6.7□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 TNFAIP2Q03169 654 aa6.7□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 ROM1Q03395 351 aa6.7□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF543Q08ER8 600 aa6.7□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 GRM1Q13255 1194 aa6.7□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 KLHDC10Q6PID8 442 aa6.7□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 PAQR3Q6TCH7 311 aa6.7□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 LRSAM1Q6UWE0 723 aa6.7□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 PCGF5Q86SE9 256 aa6.7□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 LDHDQ86WU2 507 aa6.7□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 MYCT1Q8N699 235 aa6.7□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 RSAD2Q8WXG1 361 aa6.7□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 HDAC10Q969S8 669 aa6.7□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 RGMAQ96B86 450 aa6.7□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM84AQ96KN4 292 aa6.7□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 AMNQ9BXJ7 453 aa6.7□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 BTBD1Q9H0C5 482 aa6.7□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 MTG2Q9H4K7 406 aa6.7□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 BCAS3Q9H6U6 928 aa6.7□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 KMT5AQ9NQR1 393 aa6.7□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 STAP2Q9UGK3 403 aa6.7□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 GPR52Q9Y2T5 361 aa6.7□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 ACEP12821 1306 aa6.7□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa6.69□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 A0A087WV62 115 aa6.69□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 F8W031 263 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 CA12O43570 354 aa6.69□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 TLR5O60602 858 aa6.69□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 PEX10O60683 326 aa6.69□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 IL2RBP14784 551 aa6.69□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 IL12RB1P42701 662 aa6.69□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 GRK6P43250 576 aa6.69□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 EPHB3P54753 998 aa6.69□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 GPSM2P81274 684 aa6.69□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF124Q15973 351 aa6.69□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa6.69□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 MUM1L1Q5H9M0 696 aa6.69□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 TLDC1Q6P9B6 456 aa6.69□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 BTNL9Q6UXG8 535 aa6.69□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa6.69□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 NETO2Q8NC67 525 aa6.69□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa6.69□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 GAB3Q8WWW8 586 aa6.69□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 CCT6BQ92526 530 aa6.69□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa6.69□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 AP5M1Q9H0R1 490 aa6.69□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 CNTD2Q9H8S5 307 aa6.69□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 POGKQ9P215 609 aa6.69□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa6.69□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 AKAP11Q9UKA4 1901 aa6.69□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 USP47Q96K76 1375 aa6.69□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 DLEC1Q9Y238 1755 aa6.68□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 HRKO00198 91 aa6.68□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 OPHN1O60890 802 aa6.68□□□□□ -1.34
STRADBP1-201ENST00000478954 MAP2K2P36507 400 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms