RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 L1RE1Q9UN81 338 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM50BQ9Y247 325 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 DRGXA6NNA5 263 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF785A8K8V0 405 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRIM24O15164 1050 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 AGFG2O95081 481 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 MATN4O95460 622 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANXA1P04083 346 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 GNAI2P04899 355 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPATA31D3P0C874 917 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 RARBP10826 455 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACRV1P26436 265 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 PHKA1P46020 1223 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCNJ5P48544 419 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 SOX8P57073 446 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 NOMO3P69849 1222 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 KIF22Q14807 665 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 COBLL1Q53SF7 1204 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 EMC10Q5UCC4 262 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 RNF220Q5VTB9 566 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 APOA5Q6Q788 366 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 SYT12Q8IV01 421 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 PALM2Q8IXS6 379 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 PJA1Q8NG27 643 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 C22orf23Q9BZE7 217 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 BHMT2Q9H2M3 363 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 RSAD1Q9HA92 442 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC45A2Q9UMX9 530 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCDHA6Q9UN73 950 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 LEFTY2O00292 366 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 APAF1O14727 1248 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 PMM2O15305 246 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 FRS3O43559 492 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 RECQL4O94761 1208 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 KITP10721 976 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 NPR1P16066 1061 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 GCSHP23434 173 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC7A1P30825 629 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 PICALMQ13492 652 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 SEMA5AQ13591 1074 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAP9Q49MG5 647 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 AGAP9Q5VTM2 703 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDSS2Q86YH6 399 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 RHOT2Q8IXI1 618 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMIEQ8NEW7 156 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR56A1Q8NGH5 318 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 IL31RAQ8NI17 732 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 CPT1CQ8TCG5 803 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 NUP133Q8WUM0 1156 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 SCAMP4Q969E2 229 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 MRGPRX1Q96LB2 322 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 IMPG2Q9BZV3 1241 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRRC27Q9C0I9 530 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 RNPEPQ9H4A4 650 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 TPCN1Q9ULQ1 816 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 SORCS3Q9UPU3 1222 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 CDYLQ9Y232 598 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANO9A1A5B4 782 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 DIRC3C9JPN6 131 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHEK2O96017 543 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 FCER1AP12319 257 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 BRAFP15056 766 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 PHKG2P15735 406 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF20P17024 532 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 HDCP19113 662 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 PIGFQ07326 219 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLFN5Q08AF3 891 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 EFEMP1Q12805 493 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-78P-201ENST00000362897 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms