RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 CD58P19256 250 aa19.13■□□□□ 0.65
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ACTB-201ENST00000331789 ZNF699Q32M78 642 aa19.13■□□□□ 0.65
ACTB-201ENST00000331789 USP38Q8NB14 1042 aa19.13■□□□□ 0.65
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ACTB-201ENST00000331789 BTBD6Q96KE9 485 aa19.13■□□□□ 0.65
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ACTB-201ENST00000331789 FAM53CQ9NYF3 392 aa19.12■□□□□ 0.65
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ACTB-201ENST00000331789 TRIP11Q15643 1979 aa19.12■□□□□ 0.65
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ACTB-201ENST00000331789 RASGEF1CQ8N431 466 aa19.11■□□□□ 0.65
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ACTB-201ENST00000331789 CENPCQ03188 943 aa19.1■□□□□ 0.65
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ACTB-201ENST00000331789 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP19.1■□□□□ 0.652e-24■■□□□ 12.9
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ACTB-201ENST00000331789 C8orf74Q6P047 294 aa19.1■□□□□ 0.65
ACTB-201ENST00000331789 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
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ACTB-201ENST00000331789 AP1M1Q9BXS5 423 aa19.1■□□□□ 0.65
ACTB-201ENST00000331789 MROH7Q68CQ1 1323 aa19.09■□□□□ 0.65
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