RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
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RABGGTA-208ENST00000558954 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
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RABGGTA-208ENST00000558954 LRPAP1P30533 357 aa20.46■□□□□ 0.87
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RABGGTA-208ENST00000558954 MAN1B1Q9UKM7 699 aa20.46■□□□□ 0.87
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RABGGTA-208ENST00000558954 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa20.46■□□□□ 0.87
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RABGGTA-208ENST00000558954 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
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RABGGTA-208ENST00000558954 NRIP1P48552 1158 aa20.44■□□□□ 0.86
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RABGGTA-208ENST00000558954 FAM171A1Q5VUB5 890 aa20.44■□□□□ 0.86
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RABGGTA-208ENST00000558954 RDH13Q8NBN7 331 aa20.43■□□□□ 0.86
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RABGGTA-208ENST00000558954 KIAA1468Q9P260 1216 aa20.43■□□□□ 0.86
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RABGGTA-208ENST00000558954 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
RABGGTA-208ENST00000558954 B3GALT6Q96L58 329 aa20.42■□□□□ 0.86
RABGGTA-208ENST00000558954 FNBP1Q96RU3 617 aa20.42■□□□□ 0.86
RABGGTA-208ENST00000558954 TSG101Q99816 390 aa20.42■□□□□ 0.86
RABGGTA-208ENST00000558954 TTPALQ9BTX7 342 aa20.42■□□□□ 0.86
RABGGTA-208ENST00000558954 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa20.42■□□□□ 0.86
RABGGTA-208ENST00000558954 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP20.42■□□□□ 0.86
RABGGTA-208ENST00000558954 COG5Q9UP83 839 aa20.42■□□□□ 0.86
RABGGTA-208ENST00000558954 TNNC2P02585 160 aa20.41■□□□□ 0.86
RABGGTA-208ENST00000558954 PAX3P23760 479 aa20.41■□□□□ 0.86
RABGGTA-208ENST00000558954 BRCC3P46736 316 aa20.41■□□□□ 0.86
RABGGTA-208ENST00000558954 KIAA0319Q5VV43 1072 aa20.41■□□□□ 0.86
RABGGTA-208ENST00000558954 CEP135Q66GS9 1140 aa20.41■□□□□ 0.86
RABGGTA-208ENST00000558954 CD300LGQ6UXG3 332 aa20.41■□□□□ 0.86
RABGGTA-208ENST00000558954 CEP57Q86XR8 500 aa20.41■□□□□ 0.86
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