RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541295.5

LMO3-225, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 3,498 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-225ENST00000541295 INIPQ9NRY2 104 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 USP40Q9NVE5 1235 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 GOLGA8OA6NCC3 632 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 CCDC69A6NI79 296 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 GOLGA8NF8WBI6 632 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 POTEB2H3BUK9 544 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 SNAP23O00161 211 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 PDE8AO60658 829 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 DTNBO60941 627 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 CAMTA2O94983 1202 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 ARHGEF15O94989 841 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 GDI2P50395 445 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 CCR3P51677 355 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 NOP14P78316 857 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 TJP1Q07157 1748 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 PRKG2Q13237 762 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 CYTH1Q15438 398 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 AGMOQ6ZNB7 445 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 RGS9BPQ6ZS82 235 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 RASEFQ8IZ41 740 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 TRIM63Q969Q1 353 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 FAM20AQ96MK3 541 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 HGH1Q9BTY7 390 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 EBF2Q9HAK2 575 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 KIAA1586Q9HCI6 787 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 SEC31BQ9NQW1 1179 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 POLE3Q9NRF9 147 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 NDUFA13Q9P0J0 144 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 GIMAP2Q9UG22 337 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 ANAPC5Q9UJX4 755 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 LRRIQ4A6NIV6 560 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 TRIM75PA6NK02 468 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 OR5K4A6NMS3 321 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 ERVV-1B6SEH8 477 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 THAP12O43422 761 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 NIPSNAP2O75323 286 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 TOMM70O94826 608 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 CRYZL1O95825 349 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 P4HA1P13674 534 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 PHBP35232 272 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 PHKA1P46020 1223 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 KRT6CP48668 564 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 SCRN3Q0VDG4 424 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 SSPNQ14714 243 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 MINDY4Q4G0A6 757 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 SGO2Q562F6 1265 aa6.55□□□□□ -1.36
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LMO3-225ENST00000541295 TBC1D9BQ66K14 1250 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 KCTD16Q68DU8 428 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa6.55□□□□□ -1.36
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LMO3-225ENST00000541295 FBXO41Q8TF61 875 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 CCDC138Q96M89 665 aa6.55□□□□□ -1.36
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LMO3-225ENST00000541295 MPHOSPH8Q99549 860 aa6.55□□□□□ -1.36
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LMO3-225ENST00000541295 FUT8Q9BYC5 575 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 FAM192AQ9GZU8 254 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 CAAP1Q9H8G2 361 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 SAGE1Q9NXZ1 904 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
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LMO3-225ENST00000541295 AXIN1O15169 862 aa6.54□□□□□ -1.36
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LMO3-225ENST00000541295 POU2F1P14859 743 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 NDUFV2P19404 249 aa6.54□□□□□ -1.36
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LMO3-225ENST00000541295 CYP4F8P98187 520 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 RASIP1Q5U651 963 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 USPL1Q5W0Q7 1092 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 CD302Q8IX05 232 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 CADM3Q8N126 398 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 TTC17Q96AE7 1141 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 CALN1Q9BXU9 219 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 TGIF2Q9GZN2 237 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 LMAN2LQ9H0V9 348 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 GID8Q9NWU2 228 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa6.54□□□□□ -1.36
LMO3-225ENST00000541295 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
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