RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
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PTPRK-222ENST00000532751 GLP2RO95838 553 aa23.84■■□□□ 1.41
PTPRK-222ENST00000532751 KLRC2P26717 231 aa23.84■■□□□ 1.41
PTPRK-222ENST00000532751 KCNQ1P51787 676 aa23.84■■□□□ 1.41
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PTPRK-222ENST00000532751 LLGL2Q6P1M3 1020 aa23.84■■□□□ 1.41
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PTPRK-222ENST00000532751 VWA8A3KMH1 1905 aa23.84■■□□□ 1.41
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PTPRK-222ENST00000532751 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
PTPRK-222ENST00000532751 BRSK2Q8IWQ3 736 aa23.83■■□□□ 1.41
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PTPRK-222ENST00000532751 B3GALT6Q96L58 329 aa23.83■■□□□ 1.41
PTPRK-222ENST00000532751 TIGD1Q96MW7 591 aa23.83■■□□□ 1.41
PTPRK-222ENST00000532751 RXFP1Q9HBX9 757 aa23.83■■□□□ 1.41
PTPRK-222ENST00000532751 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
PTPRK-222ENST00000532751 C2CD2Q9Y426 696 aa23.83■■□□□ 1.41
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PTPRK-222ENST00000532751 GOLGA8JA6NMD2 632 aa23.82■■□□□ 1.4
PTPRK-222ENST00000532751 RHOBTB3O94955 611 aa23.82■■□□□ 1.4
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PTPRK-222ENST00000532751 SPATA1Q5VX52 437 aa23.82■■□□□ 1.4
PTPRK-222ENST00000532751 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
PTPRK-222ENST00000532751 NT5DC4Q86YG4 428 aa23.82■■□□□ 1.4
PTPRK-222ENST00000532751 KIAA0895Q8NCT3 520 aa23.82■■□□□ 1.4
PTPRK-222ENST00000532751 C3orf58Q8NDZ4 430 aa23.82■■□□□ 1.4
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PTPRK-222ENST00000532751 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
PTPRK-222ENST00000532751 KIAA1586Q9HCI6 787 aa23.82■■□□□ 1.4
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PTPRK-222ENST00000532751 CLUL1Q15846 466 aa23.81■■□□□ 1.4
PTPRK-222ENST00000532751 RTP2Q5QGT7 225 aa23.81■■□□□ 1.4
PTPRK-222ENST00000532751 CD300LGQ6UXG3 332 aa23.81■■□□□ 1.4
PTPRK-222ENST00000532751 GOLGA5Q8TBA6 731 aa23.81■■□□□ 1.4
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PTPRK-222ENST00000532751 FNIP2Q9P278 1114 aa23.81■■□□□ 1.4
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PTPRK-222ENST00000532751 CLIC2O15247 247 aa23.8■■□□□ 1.4
PTPRK-222ENST00000532751 TEX28O15482 410 aa23.8■■□□□ 1.4
PTPRK-222ENST00000532751 TGFB1I1O43294 461 aa23.8■■□□□ 1.4
PTPRK-222ENST00000532751 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
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PTPRK-222ENST00000532751 DZANK1Q9NVP4 752 aa23.8■■□□□ 1.4
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PTPRK-222ENST00000532751 CLCN4P51793 760 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRK-222ENST00000532751 PNOCQ13519 176 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRK-222ENST00000532751 SURF1Q15526 300 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRK-222ENST00000532751 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRK-222ENST00000532751 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
PTPRK-222ENST00000532751 SLC22A17Q8WUG5 538 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRK-222ENST00000532751 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
PTPRK-222ENST00000532751 RMND1Q9NWS8 449 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRK-222ENST00000532751 DPP7Q9UHL4 492 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRK-222ENST00000532751 UNC80Q8N2C7 3258 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRK-222ENST00000532751 GRXCR2A6NFK2 248 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRK-222ENST00000532751 SPDYE4A6NLX3 237 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRK-222ENST00000532751 I3L4J1 428 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRK-222ENST00000532751 SYN3O14994 580 aa23.78■■□□□ 1.4
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