RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 ADAM15Q13444 863 aa20.65■□□□□ 0.9
PACSIN3-208ENST00000531226 PNOCQ13519 176 aa20.65■□□□□ 0.9
PACSIN3-208ENST00000531226 USP41Q3LFD5 358 aa20.65■□□□□ 0.9
PACSIN3-208ENST00000531226 CD300LGQ6UXG3 332 aa20.65■□□□□ 0.9
PACSIN3-208ENST00000531226 EP400NLQ6ZTU2 488 aa20.65■□□□□ 0.9
PACSIN3-208ENST00000531226 HS2ST1Q7LGA3 356 aa20.65■□□□□ 0.9
PACSIN3-208ENST00000531226 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
PACSIN3-208ENST00000531226 DERAQ9Y315 318 aa20.65■□□□□ 0.9
PACSIN3-208ENST00000531226 GOLGA8IPA6NC78 632 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 GOLGA8JA6NMD2 632 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 TBX10O75333 385 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 GLP2RO95838 553 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 KCNA5P22460 613 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 LTBRP36941 435 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 UBE2HP62256 183 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 KCNC3Q14003 757 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM132DQ14C87 1099 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 AAK1Q2M2I8 961 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 KIAA0319Q5VV43 1072 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 SPATA1Q5VX52 437 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 KIAA1841Q6NSI8 718 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 CLEC17AQ6ZS10 378 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 GPR65Q8IYL9 337 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 HSPBP1Q9NZL4 362 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 C2CD2Q9Y426 696 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 C2CD2LO14523 706 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 KINO60870 393 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 NDUFV1P49821 464 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM171A1Q5VUB5 890 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 NT5DC4Q86YG4 428 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 C12orf56Q8IXR9 622 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 BEST2Q8NFU1 509 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 VN1R2Q8NFZ6 395 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 B3GALT6Q96L58 329 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 CLIC2O15247 247 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 TRAPPC3O43617 180 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 KIF20AO95235 890 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 CNPP09543 421 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 BRCC3P46736 316 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 WNT7BP56706 349 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 LEXMQ3ZCV2 418 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 RTP2Q5QGT7 225 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 EFCAB13Q8IY85 973 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM130Q8N3G9 435 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 GOLGA5Q8TBA6 731 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 FBXL18Q96ME1 805 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 KLHL5Q96PQ7 755 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 ASB2Q96Q27 587 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 TTPALQ9BTX7 342 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 KCTD10Q9H3F6 313 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 RXFP1Q9HBX9 757 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 KIAA1586Q9HCI6 787 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 RMND1Q9NWS8 449 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 NUB1Q9Y5A7 615 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 C2orf16Q68DN1 1984 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF233A6NK53 670 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 H3BQ06 376 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 SMC2O95347 1197 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 SRGAP2BP0DMP2 458 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 FGFR3P22607 806 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 GUCY2FP51841 1108 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 RBM10P98175 930 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 CBWD2Q8IUF1 395 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 XXYLT1Q8NBI6 393 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 SPATA20Q8TB22 786 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 PIK3R5Q8WYR1 880 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 GSDMAQ96QA5 445 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 CLEC1BQ9P126 229 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 PDXKO00764 312 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 ADH1AP07327 375 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 MCM4P33991 863 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 CYP2J2P51589 502 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 CREMQ03060 361 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 LLGL2Q6P1M3 1020 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 PPFIBP1Q86W92 1011 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 CEP57Q86XR8 500 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC22A17Q8WUG5 538 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 CASP10Q92851 521 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 SMARCE1Q969G3 411 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 MSLNLQ96KJ4 702 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-208ENST00000531226 I3L4J1 428 aa20.59■□□□□ 0.89
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