RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496024.1

CALD1-223, Transcript of caldesmon 1, human

TSL 4

Gene CALD1, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALD1-223	ENST00000496024	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	KLRC2	P26717	231 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	GLUD2	P49448	558 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	WNT7B	P56706	349 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	ADAM15	Q13444	863 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	USP41	Q3LFD5	358 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	CD302	Q8IX05	232 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	GPD1L	Q8N335	351 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	EFHB	Q8N7U6	833 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	BEST2	Q8NFU1	509 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	SMARCE1	Q969G3	411 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	FAM84A	Q96KN4	292 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	TIGD1	Q96MW7	591 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	COG5	Q9UP83	839 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	VWA8	A3KMH1	1905 aa		10.66	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	SCN1A	P35498	2009 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	ZNF233	A6NK53	670 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	NCK2	O43639	380 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	TBX10	O75333	385 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	IL18RAP	O95256	599 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	GLP2R	O95838	553 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	ADRB2	P07550	413 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	MCM4	P33991	863 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	LTBR	P36941	435 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	KCNQ1	P51787	676 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	DSG1	Q02413	1049 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	KCNB1	Q14721	858 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	ZBTB6	Q15916	424 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	RTP2	Q5QGT7	225 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	SPATA1	Q5VX52	437 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	APOL5	Q9BWW9	433 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	ASB7	Q9H672	318 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	CHST7	Q9NS84	486 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	RMND1	Q9NWS8	449 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	STK39	Q9UEW8	545 aa		10.65	□□□□□ -0.7
CALD1-223	ENST00000496024	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	BIN1	O00499	593 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	TRAPPC3	O43617	180 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	EXOC3	O60645	756 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	LILRB3	O75022	631 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	KIF20A	O95235	890 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	EFEMP2	O95967	443 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	NR3C1	P04150	777 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	EPCAM	P16422	314 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	CYP3A5	P20815	502 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	LRPAP1	P30533	357 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	PSMD5	Q16401	504 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	CAMK4	Q16566	473 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	PALB2	Q86YC2	1186 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	GBP4	Q96PP9	640 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	GSDMA	Q96QA5	445 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	DPP3	Q9NY33	737 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	DERA	Q9Y315	318 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	IRAK3	Q9Y616	596 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		10.64	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	PDXK	O00764	312 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	TEX28	O15482	410 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	ADH1A	P07327	375 aa		10.63	□□□□□ -0.71

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