RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493427.1

ABCD4-215, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 4

Gene ABCD4, Length 736 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-215	ENST00000493427	TLE3	Q04726	772 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	USP41	Q3LFD5	358 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	FUT10	Q6P4F1	479 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	APOA5	Q6Q788	366 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	YAF2	Q8IY57	180 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	GPRASP2	Q96D09	838 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	MED8	Q96G25	268 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	PHF12	Q96QT6	1004 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	ZFHX3	Q15911	3703 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	PLK4	O00444	970 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	RNF40	O75150	1001 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	CALM1	P0DP23	149 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	CALM2	P0DP24	149 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	CALM3	P0DP25	149 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	SKI	P12755	728 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	SMARCA1	P28370	1054 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	PTGER3	P43115	390 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	FANCB	Q8NB91	859 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	BAP1	Q92560	729 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	KIF2C	Q99661	725 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	FAM117A	Q9C073	453 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	EBF1	Q9UH73	591 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	ADAM12	O43184	909 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	GNAQ	P50148	359 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	ACTR2	P61160	394 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	C2orf27A	Q580R0	203 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	RTP2	Q5QGT7	225 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	GLRX5	Q86SX6	157 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	MICU3	Q86XE3	530 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	NXPE2	Q96DL1	559 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	CDHR1	Q96JP9	859 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	MAP7D2	Q96T17	732 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	RSAD1	Q9HA92	442 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	TNFRSF10B	O14763	440 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	CHAD	O15335	359 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	ITGB5	P18084	799 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	NFATC3	Q12968	1075 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	TMC8	Q8IU68	726 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	GPR65	Q8IYL9	337 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	TMEM209	Q96SK2	561 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	SNTG2	Q9NY99	539 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	F8	P00451	2351 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	ZBTB43	O43298	467 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	RPS6KB1	P23443	525 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	CCR2	P41597	374 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	RAB27A	P51159	221 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	FUT2	Q10981	343 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	TRAF1	Q13077	416 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	MTMR1	Q13613	665 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	DMC1	Q14565	340 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	PKDCC	Q504Y2	493 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427		Q6ZUG5	572 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		13.73	□□□□□ -0.21

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