RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485019.1

RBM34-208, Transcript of RNA binding motif protein 34, human

TSL 3

Gene RBM34, Length 409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM34-208	ENST00000485019	KIF4A	O95239	1232 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	KRT13	P13646	458 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	DNAJB1	P25685	340 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	GUCY2F	P51841	1108 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	ADGRE1	Q14246	886 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	PSMD6	Q15008	389 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	FUT10	Q6P4F1	479 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	TMC7	Q7Z402	723 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	VPS52	Q8N1B4	723 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	TLR9	Q9NR96	1032 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	DPP3	Q9NY33	737 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	STK39	Q9UEW8	545 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	AKAP3	O75969	853 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	TNNC2	P02585	160 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	KRT19	P08727	400 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	LRPAP1	P30533	357 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	USP37	Q86T82	979 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	WDR49	Q8IV35	697 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	CGRRF1	Q99675	332 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	TCF25	Q9BQ70	676 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	INTS13	Q9NVM9	706 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	CEP290	O15078	2479 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	MAPK13	O15264	365 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	TRAPPC3	O43617	180 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	CXCL14	O95715	111 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	SOD2	P04179	222 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	ITGB3	P05106	788 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	IRS1	P35568	1242 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	BRCC3	P46736	316 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	ERVFC1	P60507	584 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	CEP57	Q86XR8	500 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	FAM84A	Q96KN4	292 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	ZBP1	Q9H171	429 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	13.78	□□□□□ -0.2
RBM34-208	ENST00000485019	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019		I3L4J1	428 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	C2CD2L	O14523	706 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	PHACTR2	O75167	634 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	UROD	P06132	367 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	CTSA	P10619	480 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	VAMP7	P51809	220 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	CAMK1	Q14012	370 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	NFKBIB	Q15653	356 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	USP41	Q3LFD5	358 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	TTI2	Q6NXR4	508 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	TMC2	Q8TDI7	906 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		13.77	□□□□□ -0.21

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