RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469271.1

NOM1-203, Transcript of nucleolar protein with MIF4G domain 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NOM1, Length 1,209 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1-203ENST00000469271 BEST2Q8NFU1 509 aa22.26■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 HASPINQ8TF76 798 aa22.26■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa22.26■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa22.26■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 TRIP11Q15643 1979 aa22.26■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 TGFB1I1O43294 461 aa22.25■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 NDUFV1P49821 464 aa22.25■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 LEXMQ3ZCV2 418 aa22.25■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 KIAA0319Q5VV43 1072 aa22.25■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 JADE1Q6IE81 842 aa22.25■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 BRSK2Q8IWQ3 736 aa22.25■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 AUTS2Q8WXX7 1259 aa22.25■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 SAAL1Q96ER3 474 aa22.25■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 ASB2Q96Q27 587 aa22.25■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 TTPALQ9BTX7 342 aa22.25■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 HSPBP1Q9NZL4 362 aa22.25■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 NUB1Q9Y5A7 615 aa22.25■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 BRWD1Q9NSI6 2320 aa22.25■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 LILRB3O75022 631 aa22.24■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 PAX3P23760 479 aa22.24■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 LRPAP1P30533 357 aa22.24■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 SPAG1Q07617 926 aa22.24■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 FAM171A1Q5VUB5 890 aa22.24■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 SPATA1Q5VX52 437 aa22.24■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa22.24■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 TAS1R1Q7RTX1 841 aa22.24■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 C12orf56Q8IXR9 622 aa22.24■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 GSDMAQ96QA5 445 aa22.24■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 PCIF1Q9H4Z3 704 aa22.24■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa22.24■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 ZNF233A6NK53 670 aa22.23■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 C2CD2LO14523 706 aa22.23■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 ADH1AP07327 375 aa22.23■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 TFF2Q03403 129 aa22.23■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 PNOCQ13519 176 aa22.23■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 SURF1Q15526 300 aa22.23■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 TJAP1Q5JTD0 557 aa22.23■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 CLEC17AQ6ZS10 378 aa22.23■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 CASP10Q92851 521 aa22.23■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 RXFP1Q9HBX9 757 aa22.23■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.23■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 FAM50BQ9Y247 325 aa22.23■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 LINC01565O15544 149 aa22.22■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 C1RP00736 705 aa22.22■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 NFICP08651 508 aa22.22■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 CNPP09543 421 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 LTBRP36941 435 aa22.22■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 KCNC3Q14003 757 aa22.22■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 XXYLT1Q8NBI6 393 aa22.22■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 C3orf58Q8NDZ4 430 aa22.22■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 TMEM174Q8WUU8 243 aa22.22■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 FBXL18Q96ME1 805 aa22.22■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 KLHL5Q96PQ7 755 aa22.22■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 FNIP2Q9P278 1114 aa22.22■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 A0A0C4DFX4 3053 aa22.22■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 GOLGA8IPA6NC78 632 aa22.21■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 GOLGA8JA6NMD2 632 aa22.21■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 PDXKO00764 312 aa22.21■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 SYN3O14994 580 aa22.21■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 TBX10O75333 385 aa22.21■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 GLP2RO95838 553 aa22.21■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 FGFR3P22607 806 aa22.21■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 KLRC2P26717 231 aa22.21■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa22.21■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 CEP57Q86XR8 500 aa22.21■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 PIK3R5Q8WYR1 880 aa22.21■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 SMARCE1Q969G3 411 aa22.21■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 DPP7Q9UHL4 492 aa22.21■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa22.21■■□□□ 1.15
NOM1-203ENST00000469271 H3BQ06 376 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 TEX28O15482 410 aa22.2■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 MCM4P33991 863 aa22.2■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 RTP2Q5QGT7 225 aa22.2■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 CD300LGQ6UXG3 332 aa22.2■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 ANKS3Q6ZW76 656 aa22.2■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 SPATA20Q8TB22 786 aa22.2■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 SUSD3Q96L08 255 aa22.2■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 B3GALT6Q96L58 329 aa22.2■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 GBP4Q96PP9 640 aa22.2■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 DZANK1Q9NVP4 752 aa22.2■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 DPP3Q9NY33 737 aa22.2■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 CLEC1BQ9P126 229 aa22.2■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 CD207Q9UJ71 328 aa22.2■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 ARHGEF37A1IGU5 675 aa22.19■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 CLIC2O15247 247 aa22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms