RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461648.2

TSC2-208, Transcript of TSC complex subunit 2, human

TSL 2

Gene TSC2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSC2-208	ENST00000461648	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TSC2-208	ENST00000461648	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	27.6	■■■□□ 2.01
TSC2-208	ENST00000461648	WDR49	Q8IV35	697 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TSC2-208	ENST00000461648	TMC2	Q8TDI7	906 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TSC2-208	ENST00000461648	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TSC2-208	ENST00000461648	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	27.6	■■■□□ 2.01
TSC2-208	ENST00000461648	INTS13	Q9NVM9	706 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TSC2-208	ENST00000461648	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
TSC2-208	ENST00000461648	EPOP	A6NHQ4	379 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TSC2-208	ENST00000461648		H3BNC9	293 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TSC2-208	ENST00000461648	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
TSC2-208	ENST00000461648	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TSC2-208	ENST00000461648	CCDC192	P0DO97	292 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TSC2-208	ENST00000461648	KRT13	P13646	458 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TSC2-208	ENST00000461648	TNNI1	P19237	187 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TSC2-208	ENST00000461648	GPM6B	Q13491	265 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TSC2-208	ENST00000461648	UPP1	Q16831	310 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TSC2-208	ENST00000461648	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
TSC2-208	ENST00000461648	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
TSC2-208	ENST00000461648	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TSC2-208	ENST00000461648	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
TSC2-208	ENST00000461648	TMEM169	Q96HH4	297 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TSC2-208	ENST00000461648	IGSF21	Q96ID5	467 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TSC2-208	ENST00000461648	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TSC2-208	ENST00000461648	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
TSC2-208	ENST00000461648	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
TSC2-208	ENST00000461648	MARCH5	Q9NX47	278 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TSC2-208	ENST00000461648	DPP3	Q9NY33	737 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TSC2-208	ENST00000461648	PTPRJ	Q12913	1337 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TSC2-208	ENST00000461648	PODXL	O00592	558 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TSC2-208	ENST00000461648	ITGB1	P05556	798 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TSC2-208	ENST00000461648	VAMP7	P51809	220 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TSC2-208	ENST00000461648	PLCB3	Q01970	1234 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TSC2-208	ENST00000461648	ENPEP	Q07075	957 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TSC2-208	ENST00000461648	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TSC2-208	ENST00000461648	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TSC2-208	ENST00000461648	USP37	Q86T82	979 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TSC2-208	ENST00000461648	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TSC2-208	ENST00000461648	BORCS6	Q96GS4	357 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TSC2-208	ENST00000461648	FAM84A	Q96KN4	292 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TSC2-208	ENST00000461648	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TSC2-208	ENST00000461648	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TSC2-208	ENST00000461648	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648		F8W810	466 aa		27.57	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	KIF4A	O95239	1232 aa		27.57	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	TNNC2	P02585	160 aa		27.57	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	KRT17	Q04695	432 aa		27.57	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	BFSP1	Q12934	665 aa		27.57	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		27.57	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		27.56	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		27.56	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	RFXAP	O00287	272 aa		27.56	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	TADA2A	O75478	443 aa		27.56	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	B3GAT3	O94766	335 aa		27.56	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	DLG4	P78352	724 aa		27.56	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	CLDN10	P78369	228 aa		27.56	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	GRIN2C	Q14957	1233 aa		27.56	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		27.56	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		27.56	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		27.56	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	FAM161B	Q96MY7	647 aa		27.56	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		27.56	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	GNA14	O95837	355 aa		27.55	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	AP3M2	P53677	418 aa		27.55	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	UBE3A	Q05086	875 aa		27.55	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		27.55	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		27.55	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		27.55	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		27.55	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		27.55	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	HASPIN	Q8TF76	798 aa		27.55	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	ZNF516	Q92618	1163 aa		27.55	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		27.55	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		27.55	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	LZTS1	Q9Y250	596 aa		27.55	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	ANO9	A1A5B4	782 aa		27.54	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	IKBKB	O14920	756 aa		27.54	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	GRM6	O15303	877 aa		27.54	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	27.54	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		27.54	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		27.54	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648		Q7L0L9	218 aa		27.54	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	MYO9B	Q13459	2157 aa		27.53	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	PIR	O00625	290 aa		27.53	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	PPEF2	O14830	753 aa		27.53	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	ITGB3	P05106	788 aa		27.53	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	TRIM49	P0CI25	452 aa		27.53	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	TRIM49C	P0CI26	452 aa		27.53	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	FUT10	Q6P4F1	479 aa		27.53	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		27.53	■■■□□ 2
TSC2-208	ENST00000461648	POF1B	Q8WVV4	589 aa		27.53	■■■□□ 2

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