RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440016.6

HOXD-AS2-202, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 999 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FSD2A1L4K1 749 aa29.47■■■□□ 2.31
HOXD-AS2-202ENST00000440016 C2CD2LO14523 706 aa29.47■■■□□ 2.31
HOXD-AS2-202ENST00000440016 XPOTO43592 962 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TBX10O75333 385 aa29.47■■■□□ 2.31
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GLP2RO95838 553 aa29.47■■■□□ 2.31
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NFICP08651 508 aa29.47■■■□□ 2.31
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
HOXD-AS2-202ENST00000440016 BRSK2Q8IWQ3 736 aa29.47■■■□□ 2.31
HOXD-AS2-202ENST00000440016 VN1R2Q8NFZ6 395 aa29.47■■■□□ 2.31
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
HOXD-AS2-202ENST00000440016 HSPBP1Q9NZL4 362 aa29.47■■■□□ 2.31
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa29.47■■■□□ 2.31
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DERAQ9Y315 318 aa29.47■■■□□ 2.31
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
HOXD-AS2-202ENST00000440016 XIRP2A4UGR9 3374 aa29.47■■■□□ 2.31
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RBM10P98175 930 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KCNC3Q14003 757 aa29.46■■■□□ 2.31
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FAM171A1Q5VUB5 890 aa29.46■■■□□ 2.31
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KIAA1841Q6NSI8 718 aa29.46■■■□□ 2.31
HOXD-AS2-202ENST00000440016 HS2ST1Q7LGA3 356 aa29.46■■■□□ 2.31
HOXD-AS2-202ENST00000440016 H3BQ06 376 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CLIC2O15247 247 aa29.45■■■□□ 2.31
HOXD-AS2-202ENST00000440016 IL18RAPO95256 599 aa29.45■■■□□ 2.31
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LRPAP1P30533 357 aa29.45■■■□□ 2.31
HOXD-AS2-202ENST00000440016 BRCC3P46736 316 aa29.45■■■□□ 2.31
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NDUFV1P49821 464 aa29.45■■■□□ 2.31
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GUCY2FP51841 1108 aa29.45■■■□□ 2.31
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TMEM132DQ14C87 1099 aa29.45■■■□□ 2.31
HOXD-AS2-202ENST00000440016 AAK1Q2M2I8 961 aa29.45■■■□□ 2.31
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RTP2Q5QGT7 225 aa29.45■■■□□ 2.31
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SPATA1Q5VX52 437 aa29.45■■■□□ 2.31
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KLHL5Q96PQ7 755 aa29.45■■■□□ 2.31
HOXD-AS2-202ENST00000440016 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa29.45■■■□□ 2.31
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
HOXD-AS2-202ENST00000440016 C2CD2Q9Y426 696 aa29.45■■■□□ 2.31
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KINO60870 393 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CNPP09543 421 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 WNT7BP56706 349 aa29.44■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 UBE2HP62256 183 aa29.44■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LLGL2Q6P1M3 1020 aa29.44■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 BEST2Q8NFU1 509 aa29.44■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ASB2Q96Q27 587 aa29.44■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CLEC1BQ9P126 229 aa29.44■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 I3L4J1 428 aa29.43■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KCNQ1P51787 676 aa29.43■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LEXMQ3ZCV2 418 aa29.43■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CEP57Q86XR8 500 aa29.43■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 C12orf56Q8IXR9 622 aa29.43■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 EFCAB13Q8IY85 973 aa29.43■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GPR65Q8IYL9 337 aa29.43■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TTPALQ9BTX7 342 aa29.43■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RXFP1Q9HBX9 757 aa29.43■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NUB1Q9Y5A7 615 aa29.43■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa29.43■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PLXNA3P51805 1871 aa29.42■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TRAPPC3O43617 180 aa29.42■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CYP2J2P51589 502 aa29.42■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa29.42■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CLEC17AQ6ZS10 378 aa29.42■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CBWD2Q8IUF1 395 aa29.42■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FBXL18Q96ME1 805 aa29.42■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KCTD10Q9H3F6 313 aa29.42■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KIAA1586Q9HCI6 787 aa29.42■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ZNF233A6NK53 670 aa29.41■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FGFR3P22607 806 aa29.41■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NT5DC4Q86YG4 428 aa29.41■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 XXYLT1Q8NBI6 393 aa29.41■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GOLGA5Q8TBA6 731 aa29.41■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PIK3R5Q8WYR1 880 aa29.41■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP29.41■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RMND1Q9NWS8 449 aa29.41■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa29.41■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TEX28O15482 410 aa29.4■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KIF20AO95235 890 aa29.4■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SMC2O95347 1197 aa29.4■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SRGAP2BP0DMP2 458 aa29.4■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KLRC2P26717 231 aa29.4■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SPATA20Q8TB22 786 aa29.4■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SLC22A17Q8WUG5 538 aa29.4■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MSLNLQ96KJ4 702 aa29.4■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GSDMAQ96QA5 445 aa29.4■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PDE11AQ9HCR9 933 aa29.4■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa29.4■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PDXKO00764 312 aa29.39■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PPEF2O14830 753 aa29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms