RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
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PGGT1B-202ENST00000379615 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa16.69■□□□□ 0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 NUB1Q9Y5A7 615 aa16.69■□□□□ 0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
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PGGT1B-202ENST00000379615 CLIC2O15247 247 aa16.68■□□□□ 0.26
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PGGT1B-202ENST00000379615 VN1R3Q9BXE9 311 aa16.67■□□□□ 0.26
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PGGT1B-202ENST00000379615 IGFLR1Q9H665 355 aa16.67■□□□□ 0.26
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PGGT1B-202ENST00000379615 COL19A1Q14993 1142 aa16.65■□□□□ 0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 NFIL3Q16649 462 aa16.65■□□□□ 0.26
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PGGT1B-202ENST00000379615 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa16.65■□□□□ 0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 TAS1R1Q7RTX1 841 aa16.65■□□□□ 0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa16.65■□□□□ 0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 RDH13Q8NBN7 331 aa16.65■□□□□ 0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa16.65■□□□□ 0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 APPL2Q8NEU8 664 aa16.65■□□□□ 0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 TSG101Q99816 390 aa16.65■□□□□ 0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 PDE11AQ9HCR9 933 aa16.65■□□□□ 0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 DMAC2Q9NW81 257 aa16.65■□□□□ 0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 CLDND1Q9NY35 253 aa16.65■□□□□ 0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 SYN3O14994 580 aa16.64■□□□□ 0.25
PGGT1B-202ENST00000379615 LILRB3O75022 631 aa16.64■□□□□ 0.25
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