RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361757.7

SBNO2-201, Transcript of strawberry notch homolog 2, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene SBNO2, Length 4,923 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2-201ENST00000361757 WEE2P0C1S8 567 aa20.5■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 GLTPD2A6NH11 291 aa20.49■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 ZNF185O15231 689 aa20.49■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 NNTQ13423 1086 aa20.49■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 SLC51AQ86UW1 340 aa20.49■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 TAS1R2Q8TE23 839 aa20.49■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 PORCNQ9H237 461 aa20.49■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 KIAA1257Q9ULG3 409 aa20.49■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 ITGB3P05106 788 aa20.49■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 PRLRP16471 622 aa20.49■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 GPAT2Q6NUI2 795 aa20.49■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 LRRC55Q6ZSA7 311 aa20.49■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 SCN4BQ8IWT1 228 aa20.49■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 GLT1D1Q96MS3 346 aa20.49■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 DPP3Q9NY33 737 aa20.49■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 ALG6Q9Y672 507 aa20.49■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 MSH2P43246 934 aa20.49■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 ARL4CP56559 192 aa20.49■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 SOX10P56693 466 aa20.49■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 GTF2BQ00403 316 aa20.49■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 TPCN2Q8NHX9 752 aa20.49■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 MCF2P10911 925 aa20.49■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 SKIP12755 728 aa20.49■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 BMT2Q1RMZ1 405 aa20.49■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 TMEM117Q9H0C3 514 aa20.49■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 PFDN6O15212 129 aa20.48■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 COG7P83436 770 aa20.48■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 TMEM134Q9H6X4 195 aa20.48■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 USP2O75604 605 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 STAG3L1P0CL83 205 aa20.48■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 CYP11B1P15538 503 aa20.48■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 PLCD4Q9BRC7 762 aa20.48■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 MTMR12Q9C0I1 747 aa20.48■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 TMEM150BA6NC51 233 aa20.48■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 ACADSBP45954 432 aa20.48■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 GRIK4Q16099 956 aa20.48■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 EFHC2Q5JST6 749 aa20.48■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 SLC9A9Q8IVB4 645 aa20.48■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 PYROXD1Q8WU10 500 aa20.48■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 A0A087WZ62 844 aa20.48■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 ACKR2O00590 384 aa20.48■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 MEA1Q16626 185 aa20.48■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 BBS9Q3SYG4 887 aa20.48■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 MICALL1Q8N3F8 863 aa20.48■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 C12orf42Q96LP6 360 aa20.48■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 MED15Q96RN5 788 aa20.48■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 ATICP31939 592 aa20.47■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 TAF6P49848 677 aa20.47■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 BCAR1P56945 870 aa20.47■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 ACVR2BQ13705 512 aa20.47■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 DNAAF3Q8N9W5 541 aa20.47■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 COMTP21964 271 aa20.47■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 RTP1P59025 263 aa20.47■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 SEZ6Q53EL9 994 aa20.47■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 LBX2Q6XYB7 198 aa20.47■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 ATL2Q8NHH9 583 aa20.47■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 TTC25Q96NG3 672 aa20.47■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 LRRC1Q9BTT6 524 aa20.47■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa20.47■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 SGPL1O95470 568 aa20.47■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 VTNP04004 478 aa20.47■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 CYP2C19P33261 490 aa20.47■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 PSMD6Q15008 389 aa20.47■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa20.47■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa20.47■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 CARD9Q9H257 536 aa20.47■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 PLAAQ9Y263 795 aa20.47■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 IL9RQ01113 521 aa20.46■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 BCAS4Q8TDM0 211 aa20.46■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 EXOC4Q96A65 974 aa20.46■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 FAF2Q96CS3 445 aa20.46■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 RABEP2Q9H5N1 569 aa20.46■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 SIK3Q9Y2K2 1263 aa20.46■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 SLC15A5A6NIM6 579 aa20.46■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 GPR182O15218 404 aa20.46■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 CTIFO43310 598 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 PHF2O75151 1096 aa20.46■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 PDGFRAP16234 1089 aa20.46■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 PCSK1P29120 753 aa20.46■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 DGKZQ13574 1117 aa20.46■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 C7orf43Q8WVR3 580 aa20.46■□□□□ 0.87
SBNO2-201ENST00000361757 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms