RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348333.7

TNFRSF25-201, Transcript of TNF receptor superfamily member 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFRSF25, Length 1,119 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25-201ENST00000348333 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 TSC2P49815 1807 aa24.82■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 TISP43B9A030 160 aa24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 TRAK2O60296 914 aa24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 LIG4P49917 911 aa24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 RAB33AQ14088 237 aa24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC7A14Q8TBB6 771 aa24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 A0A087X0B3 334 aa24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 TTC26A0AVF1 554 aa24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 H0YCG3 227 aa24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 CCL16O15467 120 aa24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 NARSO43776 548 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 PIGRP01833 764 aa24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 DDIT3P35638 169 aa24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 GUCY2FP51841 1108 aa24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 LIN9Q5TKA1 542 aa24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 PDXDC1Q6P996 788 aa24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 DYMQ7RTS9 669 aa24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 ANKRD63C9JTQ0 380 aa24.79■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 STX6O43752 255 aa24.79■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 TBCAO75347 108 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 NHLH1Q02575 133 aa24.79■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 PPM1LQ5SGD2 360 aa24.79■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 SFR1Q86XK3 245 aa24.79■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa24.79■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 BACE2Q9Y5Z0 518 aa24.79■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 MYMKA6NI61 221 aa24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 TRAPPC3O43617 180 aa24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 CLTAP09496 248 aa24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 ROR1Q01973 937 aa24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 TDGQ13569 410 aa24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 ANKS3Q6ZW76 656 aa24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 STAMQ92783 540 aa24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 EPS15L1Q9UBC2 864 aa24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 NUB1Q9Y5A7 615 aa24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 SCN1AP35498 2009 aa24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 TCHHQ07283 1943 aa24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 A0A0B4J269 797 aa24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 LACTBL1A8MY62 500 aa24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 TBC1D4O60343 1298 aa24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 AVPR2P30518 371 aa24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
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TNFRSF25-201ENST00000348333 MCM4P33991 863 aa24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 GTF2BQ00403 316 aa24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZBTB6Q15916 424 aa24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 MAP4K3Q8IVH8 894 aa24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 KIF12Q96FN5 646 aa24.77■■□□□ 1.56
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TNFRSF25-201ENST00000348333 KCNH6Q9H252 994 aa24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 STK17AQ9UEE5 414 aa24.77■■□□□ 1.56
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TNFRSF25-201ENST00000348333 DUSP12Q9UNI6 340 aa24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF25-201ENST00000348333 COL4A3Q01955 1670 aa24.76■■□□□ 1.55
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TNFRSF25-201ENST00000348333 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP24.76■■□□□ 1.55
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TNFRSF25-201ENST00000348333 ARPP19P56211 112 aa24.76■■□□□ 1.55
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TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC39A14Q15043 492 aa24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
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TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC8B1Q6J4K2 584 aa24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 DDX12PQ92771 950 aa24.76■■□□□ 1.55
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TNFRSF25-201ENST00000348333 SUSD3Q96L08 255 aa24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 PHOX2BQ99453 314 aa24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 MSTO1Q9BUK6 570 aa24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 CCDC39Q9UFE4 941 aa24.76■■□□□ 1.55
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TNFRSF25-201ENST00000348333 ITFG1Q8TB96 612 aa24.75■■□□□ 1.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa24.75■■□□□ 1.55
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TNFRSF25-201ENST00000348333 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
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TNFRSF25-201ENST00000348333 NASPP49321 788 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 KCNA1Q09470 495 aa24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 SNX21Q969T3 373 aa24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 FAM212AQ96EL1 285 aa24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF25-201ENST00000348333 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
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