RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298130.4

SPTSSA-201, Transcript of serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPTSSA, Length 2,777 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSA-201ENST00000298130 KRT10P13645 584 aa25.98■■□□□ 1.75
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SPTSSA-201ENST00000298130 CCDC63Q8NA47 563 aa25.98■■□□□ 1.75
SPTSSA-201ENST00000298130 MFSD14AQ96MC6 490 aa25.98■■□□□ 1.75
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SPTSSA-201ENST00000298130 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa25.98■■□□□ 1.75
SPTSSA-201ENST00000298130 C1orf112Q9NSG2 853 aa25.98■■□□□ 1.75
SPTSSA-201ENST00000298130 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
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SPTSSA-201ENST00000298130 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa25.96■■□□□ 1.75
SPTSSA-201ENST00000298130 MAPK13O15264 365 aa25.96■■□□□ 1.75
SPTSSA-201ENST00000298130 ETS1P14921 441 aa25.96■■□□□ 1.75
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SPTSSA-201ENST00000298130 TMEM270Q6UE05 265 aa25.96■■□□□ 1.75
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SPTSSA-201ENST00000298130 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
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SPTSSA-201ENST00000298130 FAM47EQ6ZV65 393 aa25.96■■□□□ 1.75
SPTSSA-201ENST00000298130 NLRX1Q86UT6 975 aa25.96■■□□□ 1.75
SPTSSA-201ENST00000298130 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa25.96■■□□□ 1.75
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SPTSSA-201ENST00000298130 TMEM143Q96AN5 459 aa25.95■■□□□ 1.75
SPTSSA-201ENST00000298130 ATG4CQ96DT6 458 aa25.95■■□□□ 1.75
SPTSSA-201ENST00000298130 PIAS1O75925 651 aa25.95■■□□□ 1.74
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SPTSSA-201ENST00000298130 L3MBTL1Q9Y468 752 aa25.95■■□□□ 1.74
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SPTSSA-201ENST00000298130 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
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SPTSSA-201ENST00000298130 IZUMO3Q5VZ72 239 aa25.95■■□□□ 1.74
SPTSSA-201ENST00000298130 NIPA1Q7RTP0 329 aa25.95■■□□□ 1.74
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SPTSSA-201ENST00000298130 ATP6V1G2O95670 118 aa25.94■■□□□ 1.74
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SPTSSA-201ENST00000298130 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
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SPTSSA-201ENST00000298130 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
SPTSSA-201ENST00000298130 ADAM22Q9P0K1 906 aa25.94■■□□□ 1.74
SPTSSA-201ENST00000298130 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa25.94■■□□□ 1.74
SPTSSA-201ENST00000298130 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
SPTSSA-201ENST00000298130 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa25.94■■□□□ 1.74
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