RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641643.1

SYT6-210, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

BASIC

Gene SYT6, Length 1,587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-210ENST00000641643 RESP18Q5W5W9 173 aa24.4■■□□□ 1.5
SYT6-210ENST00000641643 SYCE2Q6PIF2 218 aa24.4■■□□□ 1.5
SYT6-210ENST00000641643 CEP57Q86XR8 500 aa24.4■■□□□ 1.5
SYT6-210ENST00000641643 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
SYT6-210ENST00000641643 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
SYT6-210ENST00000641643 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
SYT6-210ENST00000641643 APOL5Q9BWW9 433 aa24.4■■□□□ 1.5
SYT6-210ENST00000641643 HAPLN2Q9GZV7 340 aa24.4■■□□□ 1.5
SYT6-210ENST00000641643 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa24.4■■□□□ 1.5
SYT6-210ENST00000641643 MAGEF1Q9HAY2 307 aa24.4■■□□□ 1.5
SYT6-210ENST00000641643 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa24.4■■□□□ 1.5
SYT6-210ENST00000641643 OLFML3Q9NRN5 406 aa24.4■■□□□ 1.5
SYT6-210ENST00000641643 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP24.4■■□□□ 1.5
SYT6-210ENST00000641643 KBTBD4Q9NVX7 518 aa24.4■■□□□ 1.5
SYT6-210ENST00000641643 TRIP11Q15643 1979 aa24.4■■□□□ 1.5
SYT6-210ENST00000641643 FRMD3A2A2Y4 597 aa24.39■■□□□ 1.5
SYT6-210ENST00000641643 OGTO15294 1046 aa24.39■■□□□ 1.5
SYT6-210ENST00000641643 CXCL8P10145 99 aa24.39■■□□□ 1.5
SYT6-210ENST00000641643 EPCAMP16422 314 aa24.39■■□□□ 1.5
SYT6-210ENST00000641643 SLFN12LQ6IEE8 588 aa24.39■■□□□ 1.5
SYT6-210ENST00000641643 CES5AQ6NT32 575 aa24.39■■□□□ 1.5
SYT6-210ENST00000641643 ADHFE1Q8IWW8 467 aa24.39■■□□□ 1.5
SYT6-210ENST00000641643 GPR65Q8IYL9 337 aa24.39■■□□□ 1.5
SYT6-210ENST00000641643 TTPALQ9BTX7 342 aa24.39■■□□□ 1.5
SYT6-210ENST00000641643 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
SYT6-210ENST00000641643 CITO14578 2027 aa24.39■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa24.38■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 TEX28O15482 410 aa24.38■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 TRAPPC3O43617 180 aa24.38■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 CLCN4P51793 760 aa24.38■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 CREMQ03060 361 aa24.38■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 PPP2R3AQ06190 1150 aa24.38■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 UPP1Q16831 310 aa24.38■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 ADALQ6DHV7 355 aa24.38■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 SLC22A17Q8WUG5 538 aa24.38■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 TRIM9Q9C026 710 aa24.38■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 S1PR5Q9H228 398 aa24.38■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 DPP7Q9UHL4 492 aa24.38■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 A0A0B4J269 797 aa24.37■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 ZP2Q05996 745 aa24.37■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 ITIH3Q06033 890 aa24.37■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 ALCAMQ13740 583 aa24.37■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 SLC39A4Q6P5W5 647 aa24.37■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa24.37■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 ACCSQ96QU6 501 aa24.37■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 RXFP1Q9HBX9 757 aa24.37■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 KCNH3Q9ULD8 1083 aa24.37■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 RPL9P32969 192 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 TNFSF9P41273 254 aa24.37■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 ASIC1P78348 528 aa24.37■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 POSTNQ15063 836 aa24.37■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa24.37■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 SYCP3Q8IZU3 236 aa24.37■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 FBXL18Q96ME1 805 aa24.37■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 ADAM7Q9H2U9 754 aa24.37■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 ANKRD63C9JTQ0 380 aa24.36■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 PODXLO00592 558 aa24.36■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 PPP1R37O75864 691 aa24.36■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 GLUD1P00367 558 aa24.36■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 RTP2Q5QGT7 225 aa24.36■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 PDXDC1Q6P996 788 aa24.36■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 CEP57L1Q8IYX8 460 aa24.36■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 POMGNT1Q8WZA1 660 aa24.36■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 SUSD6Q92537 303 aa24.36■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 FAM212AQ96EL1 285 aa24.36■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 KIF12Q96FN5 646 aa24.36■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 FNIP2Q9P278 1114 aa24.36■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 NUB1Q9Y5A7 615 aa24.36■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 TTC26A0AVF1 554 aa24.35■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 STRA6Q9BX79 667 aa24.35■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 CD320Q9NPF0 282 aa24.35■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 XPOTO43592 962 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 MYBP10242 640 aa24.34■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 SPAG1Q07617 926 aa24.34■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa24.34■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 PALB2Q86YC2 1186 aa24.34■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 GLYCTKQ8IVS8 523 aa24.34■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 CD302Q8IX05 232 aa24.34■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 PIK3R5Q8WYR1 880 aa24.34■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 CHAMP1Q96JM3 812 aa24.34■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 RIPOR3Q96MK2 946 aa24.34■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 NECTIN4Q96NY8 510 aa24.34■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 TSPAN18Q96SJ8 248 aa24.34■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 C7orf25Q9BPX7 421 aa24.34■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 TMEM206Q9H813 350 aa24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms