RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640501.1

PNKP-231, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, human

TSL 5

Gene PNKP, Length 151 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNKP-231	ENST00000640501	EFCC1	Q9HA90	598 aa		8.92	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		8.92	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	ABCB6	Q9NP58	842 aa		8.92	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	8.92	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		8.92	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	8.92	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		8.92	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		8.92	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		8.92	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	8.92	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		8.92	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	L1RE1	Q9UN81	338 aa		8.92	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		8.92	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	8.91	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	KRIT1	O00522	736 aa		8.91	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	MED7	O43513	233 aa		8.91	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	SPOP	O43791	374 aa		8.91	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	8.91	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	8.91	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	SGPL1	O95470	568 aa		8.91	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	TBC1D8	O95759	1140 aa		8.91	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	LGALS2	P05162	132 aa		8.91	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	CLTA	P09496	248 aa		8.91	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	MCF2	P10911	925 aa		8.91	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	8.91	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	GJA5	P36382	358 aa		8.91	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	DNA2	P51530	1060 aa		8.91	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	PTEN	P60484	403 aa		8.91	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	ARHGAP1	Q07960	439 aa		8.91	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	CUL1	Q13616	776 aa		8.91	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	NCOA4	Q13772	614 aa		8.91	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	GRB14	Q14449	540 aa		8.91	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	8.91	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		8.91	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		8.91	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	8.91	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	8.91	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	8.91	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		8.91	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	ZNF410	Q86VK4	478 aa		8.91	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	8.91	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	CD302	Q8IX05	232 aa		8.91	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		8.91	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	8.91	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	WHAMM	Q8TF30	809 aa		8.91	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	SEMA4D	Q92854	862 aa		8.91	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		8.91	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	FGD4	Q96M96	766 aa		8.91	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		8.91	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	PSMB7	Q99436	277 aa		8.91	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	8.91	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	TINF2	Q9BSI4	451 aa		8.91	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	FUT8	Q9BYC5	575 aa		8.91	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		8.91	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	FZD8	Q9H461	694 aa		8.91	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	AKT3	Q9Y243	479 aa		8.91	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		8.91	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		8.9	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501		H3BRB1	525 aa		8.9	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	8.9	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	MAP2K7	O14733	419 aa		8.9	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	OPA1	O60313	960 aa		8.9	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	B4GALT4	O60513	344 aa		8.9	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	8.9	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	C22orf31	O95567	290 aa		8.9	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	8.9	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	CYP1A2	P05177	515 aa		8.9	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	CALB1	P05937	261 aa		8.9	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	INSRR	P14616	1297 aa		8.9	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	GNA15	P30679	374 aa		8.9	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	ATIC	P31939	592 aa		8.9	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	8.9	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	TAP1	Q03518	808 aa		8.9	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	ACVR2B	Q13705	512 aa		8.9	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	8.9	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	CASP8	Q14790	479 aa		8.9	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	TAF3	Q5VWG9	929 aa		8.9	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		8.9	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	8.9	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	ZBTB33	Q86T24	672 aa		8.9	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		8.9	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		8.9	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		8.9	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	8.9	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		8.9	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		8.9	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	MAML3	Q96JK9	1138 aa		8.9	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		8.9	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		8.9	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	EPC1	Q9H2F5	836 aa		8.9	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	ASB7	Q9H672	318 aa		8.9	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	8.9	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	8.9	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	8.9	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	8.9	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	8.9	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	8.9	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	8.9	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		8.9	□□□□□ -0.98
PNKP-231	ENST00000640501	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	8.9	□□□□□ -0.98

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms