RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640499.1

VEGFA-231, Transcript of vascular endothelial growth factor A, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene VEGFA, Length 1,188 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VEGFA-231	ENST00000640499	CLCNKB	P51801	687 aa		29.08	■■■□□ 2.25
VEGFA-231	ENST00000640499	TFF2	Q03403	129 aa		29.08	■■■□□ 2.25
VEGFA-231	ENST00000640499	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		29.08	■■■□□ 2.25
VEGFA-231	ENST00000640499	KYAT1	Q16773	422 aa		29.08	■■■□□ 2.25
VEGFA-231	ENST00000640499	UPP1	Q16831	310 aa		29.08	■■■□□ 2.25
VEGFA-231	ENST00000640499	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		29.08	■■■□□ 2.25
VEGFA-231	ENST00000640499	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		29.08	■■■□□ 2.25
VEGFA-231	ENST00000640499	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	29.08	■■■□□ 2.25
VEGFA-231	ENST00000640499	CXCL14	O95715	111 aa		29.07	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	GART	P22102	1010 aa		29.07	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	NRIP1	P48552	1158 aa		29.07	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	WNT7B	P56706	349 aa		29.07	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	POSTN	Q15063	836 aa		29.07	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	DUSP6	Q16828	381 aa		29.07	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	29.07	■■■□□ 2.24	3e-13	■■□□□ 13.7
VEGFA-231	ENST00000640499	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		29.07	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		29.07	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	HASPIN	Q8TF76	798 aa		29.07	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	IGFLR1	Q9H665	355 aa		29.07	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		29.07	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	NR1I2	O75469	434 aa		29.06	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	SOD2	P04179	222 aa		29.06	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	ADAM15	Q13444	863 aa		29.06	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	KCNC3	Q14003	757 aa		29.06	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	FUT10	Q6P4F1	479 aa		29.06	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		29.06	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	HLA-C	Q95604	372 aa		29.06	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	SAAL1	Q96ER3	474 aa		29.06	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		29.06	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		29.06	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	TLE6	Q9H808	572 aa		29.06	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	CHST7	Q9NS84	486 aa		29.06	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		29.06	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	IRAK3	Q9Y616	596 aa		29.06	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	GLP2R	O95838	553 aa		29.05	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	PTPN14	Q15678	1187 aa		29.05	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		29.05	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		29.05	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	B3GALT6	Q96L58	329 aa		29.05	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	29.05	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	THEG	Q9P2T0	379 aa		29.05	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		29.04	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	TADA2A	O75478	443 aa		29.04	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	PSMD2	Q13200	908 aa		29.04	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	PNOC	Q13519	176 aa		29.04	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	EFHB	Q8N7U6	833 aa		29.04	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		29.04	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	EXOC1	Q9NV70	894 aa		29.04	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		29.04	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	COG5	Q9UP83	839 aa		29.04	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	UBE4B	O95155	1302 aa		29.03	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		29.03	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		29.03	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	RHOBTB3	O94955	611 aa		29.03	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	GUCY2F	P51841	1108 aa		29.03	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		29.03	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	JADE1	Q6IE81	842 aa		29.03	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		29.03	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	KIF12	Q96FN5	646 aa		29.03	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	TIGD1	Q96MW7	591 aa		29.03	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	UROC1	Q96N76	676 aa		29.03	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		29.03	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	29.02	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	TBX10	O75333	385 aa		29.02	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	B3GAT3	O94766	335 aa		29.02	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	NFIC	P08651	508 aa		29.02	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	29.02	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	29.02	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	FAM212A	Q96EL1	285 aa		29.02	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	CLDND1	Q9NY35	253 aa		29.02	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	CLEC1B	Q9P126	229 aa		29.02	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	VWA8	A3KMH1	1905 aa		29.02	■■■□□ 2.24
VEGFA-231	ENST00000640499	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	29.01	■■■□□ 2.23
VEGFA-231	ENST00000640499	PODXL	O00592	558 aa		29.01	■■■□□ 2.23
VEGFA-231	ENST00000640499	DSG1	Q02413	1049 aa		29.01	■■■□□ 2.23
VEGFA-231	ENST00000640499	KANK3	Q6NY19	840 aa		29.01	■■■□□ 2.23
VEGFA-231	ENST00000640499	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		29.01	■■■□□ 2.23
VEGFA-231	ENST00000640499	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		29.01	■■■□□ 2.23
VEGFA-231	ENST00000640499	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	29.01	■■■□□ 2.23
VEGFA-231	ENST00000640499	STK39	Q9UEW8	545 aa		29.01	■■■□□ 2.23
VEGFA-231	ENST00000640499		A0A0C4DFX4	3053 aa		29.01	■■■□□ 2.23
VEGFA-231	ENST00000640499	NCK2	O43639	380 aa		29	■■■□□ 2.23
VEGFA-231	ENST00000640499	EXTL3	O43909	919 aa		29	■■■□□ 2.23
VEGFA-231	ENST00000640499	KCNA5	P22460	613 aa		29	■■■□□ 2.23
VEGFA-231	ENST00000640499	LRPAP1	P30533	357 aa		29	■■■□□ 2.23
VEGFA-231	ENST00000640499	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	29	■■■□□ 2.23
VEGFA-231	ENST00000640499	KCNB1	Q14721	858 aa		29	■■■□□ 2.23
VEGFA-231	ENST00000640499	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	29	■■■□□ 2.23
VEGFA-231	ENST00000640499	RTP2	Q5QGT7	225 aa		29	■■■□□ 2.23
VEGFA-231	ENST00000640499	CD302	Q8IX05	232 aa		29	■■■□□ 2.23
VEGFA-231	ENST00000640499	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		29	■■■□□ 2.23
VEGFA-231	ENST00000640499	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	29	■■■□□ 2.23
VEGFA-231	ENST00000640499	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		29	■■■□□ 2.23

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