RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635397.1

SMARCA2-241, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2, humanhuman

TSL 4

Gene SMARCA2, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2-241ENST00000635397 ARL8AQ96BM9 186 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 CEP95Q96GE4 821 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 ARPC5LQ9BPX5 153 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 EPC1Q9H2F5 836 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 KIAA1586Q9HCI6 787 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 ATRNL1Q5VV63 1379 aa6.69□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 A0A1W2PRX2 142 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 PMS2P1A4D2B8 440 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 SLC7A1P30825 629 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 PIK3CBP42338 1070 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 KCNC1P48547 511 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 CIAPIN1Q6FI81 312 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 PPP1R3BQ86XI6 285 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 ACRBPQ8NEB7 543 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 ANKS1AQ92625 1134 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 PGBD4Q96DM1 585 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 TCF25Q9BQ70 676 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 BTBD1Q9H0C5 482 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 SNX13Q9Y5W8 968 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 USP19O94966 1318 aa6.68□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 MATN2O00339 956 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 GRM6O15303 877 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 B4GALT3O60512 393 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 ATP5JP18859 108 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 TM4SF4P48230 202 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 PLEKHH3Q7Z736 793 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 FAM90A1Q86YD7 464 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 POU5F2Q8N7G0 328 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 PHKBQ93100 1093 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 CCDC138Q96M89 665 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 MYOCQ99972 504 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 MRI1Q9BV20 369 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 KCNH6Q9H252 994 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 OGDHLQ9ULD0 1010 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 CORO2BQ9UQ03 480 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 PAX4O43316 350 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 NOBOXO60393 691 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 AHSGP02765 367 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 SBK3P0C264 359 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 NPR1P16066 1061 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 PIK3CGP48736 1102 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 PRIM2P49643 509 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 NT5DC1Q5TFE4 455 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 SEM1Q6ZVN7 128 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 LGI4Q8N135 537 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 DPYSL5Q9BPU6 564 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 ZNF287Q9HBT7 754 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 SLAMF7Q9NQ25 335 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 FNIP2Q9P278 1114 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 DMTF1Q9Y222 760 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 ISM1B1AKI9 464 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 KPNA5O15131 536 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 CDC14BO60729 498 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 STC2O76061 302 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 BRAFP15056 766 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 RPL17P18621 184 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 CR2P20023 1033 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 DACT2Q5SW24 774 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 XRRA1Q6P2D8 792 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 GPR135Q8IZ08 494 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 SLC35B2Q8TB61 432 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 MRGPRX1Q96LB2 322 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 RIPOR3Q96MK2 946 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 LRRC37BQ96QE4 947 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 LMF1Q96S06 567 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 PACSIN1Q9BY11 444 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 RSAD1Q9HA92 442 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 PLCB1Q9NQ66 1216 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 SLC23A1Q9UHI7 598 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 OAZ3Q9UMX2 235 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCA2-241ENST00000635397 RASA4BC9J798 803 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCA2-241ENST00000635397 MYO1FO00160 1098 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCA2-241ENST00000635397 RASA4O43374 803 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCA2-241ENST00000635397 GNAI3P08754 354 aa6.64□□□□□ -1.35
SMARCA2-241ENST00000635397 SETSIPP0DME0 302 aa6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms