RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613013.1

UBXN8-206, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 2

Gene UBXN8, Length 528 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-206ENST00000613013 DYMQ7RTS9 669 aa10□□□□□ -0.81
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UBXN8-206ENST00000613013 CPT1AP50416 773 aa9.97□□□□□ -0.81
UBXN8-206ENST00000613013 FAM193AP78312 1265 aa9.97□□□□□ -0.81
UBXN8-206ENST00000613013 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
UBXN8-206ENST00000613013 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
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