RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	XYLB	O75191	536 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	B3GAT3	O94766	335 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	OR52Z1	P0C646	297 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	CD72	P21854	359 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	RPA1	P27694	616 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	BRCC3	P46736	316 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	TRIM29	Q14134	588 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	DCLK2	Q8N568	766 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TTLL3-233	ENST00000602338	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	SHISA7	A6NL88	538 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	CEBPB	P17676	345 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF174	Q15697	407 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	UPP1	Q16831	310 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	PDXDC1	Q6P996	788 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	SHD	Q96IW2	340 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	SPTBN2	O15020	2390 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	RHO	P08100	348 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	NEK4	P51957	841 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	ROR1	Q01973	937 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	PRKCQ	Q04759	706 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	NBR1	Q14596	966 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	PPP2R5A	Q15172	486 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	UVSSA	Q2YD98	709 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	ERMN	Q8TAM6	284 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	RUBCN	Q92622	972 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	HINFP	Q9BQA5	517 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	CDT1	Q9H211	546 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	F5	P12259	2224 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	MYH11	P35749	1972 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	WDR27	A2RRH5	827 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	FCAR	P24071	287 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	EFNA5	P52803	228 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	TTC38	Q5R3I4	469 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	DAW1	Q8N136	415 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	UROC1	Q96N76	676 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	BCO2	Q9BYV7	579 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM170B	A6NMN3	283 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	ABLIM1	O14639	778 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	ECI2	O75521	394 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	GRM5	P41594	1212 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	CCR2	P41597	374 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	NPTX2	P47972	431 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	OSTN	P61366	133 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	PFKP	Q01813	784 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	XKR4	Q5GH76	650 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	KIFAP3	Q92845	792 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	C8orf76	Q96K31	380 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	IFT74	Q96LB3	600 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-233	ENST00000602338	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		13.11	□□□□□ -0.31

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