RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544805.1

RNF10-222, Transcript of ring finger protein 10, human

TSL 2

Gene RNF10, Length 536 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF10-222	ENST00000544805	HOXC6	P09630	235 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	PDHB	P11177	359 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	STMN1	P16949	149 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	SLC8A3	P57103	927 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	CYP4A11	Q02928	519 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	9.63	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	SEPT6	Q14141	434 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	NFE2L1	Q14494	772 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	PSMD6	Q15008	389 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	CHST3	Q7LGC8	479 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	GPT2	Q8TD30	523 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	MAP4K1	Q92918	833 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	MTMR9	Q96QG7	549 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	IL25	Q9H293	177 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	PFAS	O15067	1338 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	KRBA1	A5PL33	1030 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	LRRC72	A6NJI9	287 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	KBTBD13	C9JR72	458 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	ATP2A1	O14983	1001 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	ATP8B1	O43520	1251 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	PRMT3	O60678	531 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	F2	P00734	622 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	ICAM1	P05362	532 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	FES	P07332	822 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	RARB	P10826	455 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	TYRP1	P17643	537 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	MUT	P22033	750 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	CALML3	P27482	149 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	ETV3	P41162	512 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	CLDN10	P78369	228 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	CDK17	Q00537	523 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	ZNF543	Q08ER8	600 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	REPS2	Q8NFH8	660 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	GIMAP5	Q96F15	307 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	PSKH2	Q96QS6	385 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		9.61	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805		B4DLN1	442 aa		9.61	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	ALG1L2	C9J202	215 aa		9.61	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	9.61	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	SEPT4	O43236	478 aa		9.61	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	SULT1B1	O43704	296 aa		9.61	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	9.61	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	MX2	P20592	715 aa		9.61	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	KRT20	P35900	424 aa		9.61	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	CD86	P42081	329 aa		9.61	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	ETV1	P50549	477 aa		9.61	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	B2M	P61769	119 aa		9.61	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	DAB2	P98082	770 aa		9.61	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	ZBTB16	Q05516	673 aa		9.61	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		9.61	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
RNF10-222	ENST00000544805	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		9.61	□□□□□ -0.87

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