RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538333.3

LIMK1-208, Transcript of LIM domain kinase 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LIMK1, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1-208ENST00000538333 LRRC31Q6UY01 552 aa15.02□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 PRELID2Q8N945 189 aa15.02□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 CLMNQ96JQ2 1002 aa15.02□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 CGRRF1Q99675 332 aa15.02□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 PAGR1Q9BTK6 254 aa15.02□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 MSTO1Q9BUK6 570 aa15.02□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP15.02□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa15.02□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa15.02□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 NFS1Q9Y697 457 aa15.02□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 CXCL11O14625 94 aa15.01□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 PHF2O75151 1096 aa15.01□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 ARIH2O95376 493 aa15.01□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 PYGMP11217 842 aa15.01□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 DR1Q01658 176 aa15.01□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 EEPD1Q7L9B9 569 aa15.01□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 ERO1BQ86YB8 467 aa15.01□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 LRRC45Q96CN5 670 aa15.01□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 TXNRD2Q9NNW7 524 aa15.01□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 PLAAQ9Y263 795 aa15.01□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 FAM187AA6NFU0 413 aa15.01□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 TTLL13PA6NNM8 815 aa15.01□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 FAM189A1O60320 539 aa15.01□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 BIRC3Q13489 604 aa15.01□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 LRIG3Q6UXM1 1119 aa15.01□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 MCOLN2Q8IZK6 566 aa15.01□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 GLG1Q92896 1179 aa15.01□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 ERP44Q9BS26 406 aa15.01□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 CCDC113Q9H0I3 377 aa15.01□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 RAB17Q9H0T7 212 aa15.01□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 DPH5Q9H2P9 285 aa15.01□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 KCNH4Q9UQ05 1017 aa15.01□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 PPME1Q9Y570 386 aa15.01□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 SPDYE5A6NIY4 337 aa15□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 ZBTB42B2RXF5 422 aa15□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 SPOPO43791 374 aa15□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 SLC25A27O95847 323 aa15□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 PTGIRP43119 386 aa15□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 BPIFB4P59827 614 aa15□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 SKOR1P84550 965 aa15□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 CENPCQ03188 943 aa15□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 CUL2Q13617 745 aa15□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 CYP1B1Q16678 543 aa15□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 SEL1L2Q5TEA6 688 aa15□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 ZPBP2Q6X784 338 aa15□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 TMC3Q7Z5M5 1100 aa15□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 JAMLQ86YT9 394 aa15□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 OR5B17Q8NGF7 314 aa15□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 FAM167AQ96KS9 214 aa15□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 GPR20Q99678 358 aa15□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 PCYOX1Q9UHG3 505 aa15□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa15□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 CNTN6Q9UQ52 1028 aa15□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa15□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 MSCO60682 206 aa15□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 LGR5O75473 907 aa15□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 CHRNA3P32297 505 aa15□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 DRG2P55039 364 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 MOGSQ13724 837 aa15□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 HSDL1Q3SXM5 330 aa15□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 SH2D3CQ8N5H7 860 aa15□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 C18orf8Q96DM3 657 aa15□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 TXLNGYQ9BZA5 131 aa15□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa15□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 RBPJLQ9UBG7 517 aa15□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 MROH7Q68CQ1 1323 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 PGK2P07205 417 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 CLTAP09496 248 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 Q3C1V9 767 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 SEZ6Q53EL9 994 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 EMC10Q5UCC4 262 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 SCARA3Q6AZY7 606 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 TTC27Q6P3X3 843 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 MOB2Q70IA6 237 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 MON1BQ7L1V2 547 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 BRSK2Q8IWQ3 736 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 CPA5Q8WXQ8 436 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 ANAPC7Q9UJX3 599 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 NUB1Q9Y5A7 615 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 MYBL1P10243 752 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 RRM1P23921 792 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 EFNA5P52803 228 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 RWDD2BP57060 319 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 NOP14P78316 857 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms