RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478582.5

CCM2-211, Transcript of CCM2 scaffold protein, human

TSL 3

Gene CCM2, Length 937 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCM2-211	ENST00000478582	VCAN	P13611	3396 aa		29.13	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	NCK2	O43639	380 aa		29.13	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	EXTL3	O43909	919 aa		29.13	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	FGF18	O76093	207 aa		29.13	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	ALDH2	P05091	517 aa		29.13	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	PPM1A	P35813	382 aa		29.13	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	TUSC3	Q13454	348 aa		29.13	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	COL19A1	Q14993	1142 aa		29.13	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		29.13	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	GPD1L	Q8N335	351 aa		29.13	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	29.13	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	FBXL18	Q96ME1	805 aa		29.13	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	29.13	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		29.13	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	SPG21	Q9NZD8	308 aa		29.13	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		29.13	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		29.13	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	MBD3	O95983	291 aa		29.12	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	SLC11A1	P49279	550 aa		29.12	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	PLCB3	Q01970	1234 aa		29.12	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		29.12	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	MORC3	Q14149	939 aa		29.12	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		29.12	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	SAAL1	Q96ER3	474 aa		29.12	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		29.12	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	ASB7	Q9H672	318 aa		29.12	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		29.12	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		29.12	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		29.12	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	LACTBL1	A8MY62	500 aa		29.11	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	CLIC2	O15247	247 aa		29.11	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	CSPG5	O95196	566 aa		29.11	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	KCNA5	P22460	613 aa		29.11	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	PBX3	P40426	434 aa		29.11	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	PRCP	P42785	496 aa		29.11	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		29.11	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		29.11	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	29.11	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		29.11	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		29.11	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		29.11	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	29.11	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	29.1	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	NRP1	O14786	923 aa		29.1	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	IRS1	P35568	1242 aa		29.1	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	HYAL1	Q12794	435 aa		29.1	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	MYBPC2	Q14324	1141 aa		29.1	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	29.1	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	ZBTB6	Q15916	424 aa		29.1	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	NFIL3	Q16649	462 aa		29.1	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		29.1	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		29.1	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	29.1	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	DMAC2	Q9NW81	257 aa		29.1	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	LZTS1	Q9Y250	596 aa		29.1	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	29.09	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		29.09	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	29.09	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	BMP6	P22004	513 aa		29.09	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	PPP1R2	P41236	205 aa		29.09	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		29.09	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	ADSSL1	Q8N142	457 aa		29.09	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		29.09	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	IGSF21	Q96ID5	467 aa		29.09	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	DERA	Q9Y315	318 aa		29.09	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	CIT	O14578	2027 aa		29.09	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		29.08	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		29.08	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		29.08	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	IL18RAP	O95256	599 aa		29.08	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	OR1G1	P47890	313 aa		29.08	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		29.08	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		29.08	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	ISM2	Q6H9L7	571 aa		29.08	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	UROC1	Q96N76	676 aa		29.08	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	TLR9	Q9NR96	1032 aa		29.08	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	CLDND1	Q9NY35	253 aa		29.08	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	29.08	■■■□□ 2.25
CCM2-211	ENST00000478582	ZNF233	A6NK53	670 aa		29.07	■■■□□ 2.24
CCM2-211	ENST00000478582	CYP3A5	P20815	502 aa		29.07	■■■□□ 2.24
CCM2-211	ENST00000478582	CYP2J2	P51589	502 aa		29.07	■■■□□ 2.24
CCM2-211	ENST00000478582	KRT17	Q04695	432 aa		29.07	■■■□□ 2.24
CCM2-211	ENST00000478582	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
CCM2-211	ENST00000478582	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		29.07	■■■□□ 2.24
CCM2-211	ENST00000478582	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	29.07	■■■□□ 2.24
CCM2-211	ENST00000478582	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	29.07	■■■□□ 2.24
CCM2-211	ENST00000478582	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		29.07	■■■□□ 2.24
CCM2-211	ENST00000478582	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		29.07	■■■□□ 2.24
CCM2-211	ENST00000478582	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	29.07	■■■□□ 2.24
CCM2-211	ENST00000478582	C2CD2	Q9Y426	696 aa		29.07	■■■□□ 2.24
CCM2-211	ENST00000478582	ERVFC1	P60507	584 aa		29.06	■■■□□ 2.24
CCM2-211	ENST00000478582	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24
CCM2-211	ENST00000478582	CENPP	Q6IPU0	288 aa		29.06	■■■□□ 2.24
CCM2-211	ENST00000478582	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		29.06	■■■□□ 2.24
CCM2-211	ENST00000478582	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		29.06	■■■□□ 2.24
CCM2-211	ENST00000478582	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		29.06	■■■□□ 2.24
CCM2-211	ENST00000478582	FAM212A	Q96EL1	285 aa		29.06	■■■□□ 2.24
CCM2-211	ENST00000478582	KIF12	Q96FN5	646 aa		29.06	■■■□□ 2.24
CCM2-211	ENST00000478582	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
CCM2-211	ENST00000478582	TMEM169	Q96HH4	297 aa		29.06	■■■□□ 2.24

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