RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454996.5

TTC28-AS1-220, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28-AS1, Length 837 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PARM1Q6UWI2 310 aa8.39□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SIX5Q8N196 739 aa8.39□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PIK3R5Q8WYR1 880 aa8.39□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FGF14Q92915 247 aa8.39□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TBC1D32Q96NH3 1257 aa8.39□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ADPGKQ9BRR6 497 aa8.39□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TCHPQ9BT92 498 aa8.39□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KCNH6Q9H252 994 aa8.39□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa8.39□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PIDD1Q9HB75 910 aa8.39□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa8.39□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 EPS15L1Q9UBC2 864 aa8.39□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 STK39Q9UEW8 545 aa8.39□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa8.39□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FBXW11Q9UKB1 542 aa8.39□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CLIC4Q9Y696 253 aa8.39□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CDY1Q9Y6F8 540 aa8.39□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NOTCH4Q99466 2003 aa8.39□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa8.38□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TISP43B9A030 160 aa8.38□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ANHXE9PGG2 379 aa8.38□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 H3BQV1 296 aa8.38□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 LAD1O00515 517 aa8.38□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PODXLO00592 558 aa8.38□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ST18O60284 1047 aa8.38□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TBC1D4O60343 1298 aa8.38□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SEC24AO95486 1093 aa8.38□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 C8AP07357 584 aa8.38□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PLS3P13797 630 aa8.38□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FSHRP23945 695 aa8.38□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 GUCY2CP25092 1073 aa8.38□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ARPP19P56211 112 aa8.38□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RAB33AQ14088 237 aa8.38□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MCM6Q14566 821 aa8.38□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KARSQ15046 597 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SLC5A9Q2M3M2 681 aa8.38□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MPZL3Q6UWV2 235 aa8.38□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SLC7A14Q8TBB6 771 aa8.38□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 GPR152Q8TDT2 470 aa8.38□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 HDAC7Q8WUI4 952 aa8.38□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ING5Q8WYH8 240 aa8.38□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 EPSTI1Q96J88 318 aa8.38□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SNX27Q96L92 541 aa8.38□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ACAP3Q96P50 834 aa8.38□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa8.38□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP8.38□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FOXD4L1Q9NU39 408 aa8.38□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa8.38□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa8.38□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MTRRQ9UBK8 725 aa8.38□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CA14Q9ULX7 337 aa8.38□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 POLIQ9UNA4 740 aa8.38□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 DUSP12Q9UNI6 340 aa8.38□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SMC3Q9UQE7 1217 aa8.38□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NUMBLQ9Y6R0 609 aa8.38□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 DOCK8Q8NF50 2099 aa8.38□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa8.37□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 WDR27A2RRH5 827 aa8.37□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ANKRD63C9JTQ0 380 aa8.37□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa8.37□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PPEF2O14830 753 aa8.37□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 LRRN2O75325 713 aa8.37□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CXCL8P10145 99 aa8.37□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MCF2P10911 925 aa8.37□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KCNE1P15382 129 aa8.37□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NMT1P30419 496 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PTPN5P54829 565 aa8.37□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 GPC5P78333 572 aa8.37□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 HTR4Q13639 388 aa8.37□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PPM1LQ5SGD2 360 aa8.37□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SLC39A4Q6P5W5 647 aa8.37□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 GPR65Q8IYL9 337 aa8.37□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SPIRE2Q8WWL2 714 aa8.37□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FGF13Q92913 245 aa8.37□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 DRC1Q96MC2 740 aa8.37□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CLIC6Q96NY7 704 aa8.37□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FIZ1Q96SL8 496 aa8.37□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 REEP2Q9BRK0 252 aa8.37□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa8.37□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RAB34Q9BZG1 259 aa8.37□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 IGSF9Q9P2J2 1179 aa8.37□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FBXL21Q9UKT6 434 aa8.37□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms