RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392496.3

SPHK1-202, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 1,779 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-202ENST00000392496 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
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SPHK1-202ENST00000392496 HAS3O00219 553 aa22.96■■□□□ 1.27
SPHK1-202ENST00000392496 B4GALT4O60513 344 aa22.96■■□□□ 1.27
SPHK1-202ENST00000392496 IL18RAPO95256 599 aa22.96■■□□□ 1.27
SPHK1-202ENST00000392496 CYP11B1P15538 503 aa22.96■■□□□ 1.27
SPHK1-202ENST00000392496 CHRNB2P17787 502 aa22.96■■□□□ 1.27
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SPHK1-202ENST00000392496 PDE6CP51160 858 aa22.96■■□□□ 1.27
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SPHK1-202ENST00000392496 TRPA1O75762 1119 aa22.95■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 GZMAP12544 262 aa22.95■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 PSEN2P49810 448 aa22.95■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 KYAT1Q16773 422 aa22.95■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 TEX35Q5T0J7 233 aa22.95■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 SLC47A2Q86VL8 602 aa22.95■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 DNAAF5Q86Y56 855 aa22.95■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 PALB2Q86YC2 1186 aa22.95■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 PPP1R16BQ96T49 567 aa22.95■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 TLR10Q9BXR5 811 aa22.95■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 PDZD7Q9H5P4 517 aa22.95■■□□□ 1.26
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SPHK1-202ENST00000392496 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 ANK1P16157 1881 aa22.95■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa22.94■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 GPR25O00155 361 aa22.94■■□□□ 1.26
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SPHK1-202ENST00000392496 AKR1A1P14550 325 aa22.94■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 NOP2P46087 812 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 CDR2Q01850 454 aa22.94■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 CUL2Q13617 745 aa22.94■■□□□ 1.26
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SPHK1-202ENST00000392496 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa22.94■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 ELMO3Q96BJ8 720 aa22.94■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 FAM212AQ96EL1 285 aa22.94■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa22.94■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 SCLT1Q96NL6 688 aa22.94■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 IMPG2Q9BZV3 1241 aa22.94■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 RNF186Q9NXI6 227 aa22.94■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 TMCO5BA8MYB1 307 aa22.94■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 RTN2O75298 545 aa22.94■■□□□ 1.26
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SPHK1-202ENST00000392496 SMYD5Q6GMV2 418 aa22.94■■□□□ 1.26
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SPHK1-202ENST00000392496 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 CEP120Q8N960 986 aa22.94■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 TPCN2Q8NHX9 752 aa22.94■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 RFFLQ8WZ73 363 aa22.94■■□□□ 1.26
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SPHK1-202ENST00000392496 KATNAL1Q9BW62 490 aa22.94■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 CFHR5Q9BXR6 569 aa22.94■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 TAS2R14Q9NYV8 317 aa22.94■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 THSD7BQ9C0I4 1608 aa22.93■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 ASS1P00966 412 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 MYL3P08590 195 aa22.93■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 PSMC4P43686 418 aa22.93■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 FMO1Q01740 532 aa22.93■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 LRRC57Q8N9N7 239 aa22.93■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
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SPHK1-202ENST00000392496 MTMR12Q9C0I1 747 aa22.93■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 ADAMTS10Q9H324 1103 aa22.93■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 TSPAN1O60635 241 aa22.92■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 ERLIN2O94905 339 aa22.92■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 TNNC2P02585 160 aa22.92■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 TMEM191BP0C7N4 346 aa22.92■■□□□ 1.26
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SPHK1-202ENST00000392496 TAF3Q5VWG9 929 aa22.92■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 ZNF677Q86XU0 584 aa22.92■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa22.92■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 CPB2Q96IY4 423 aa22.92■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 ARID3AQ99856 593 aa22.92■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 NUB1Q9Y5A7 615 aa22.92■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 NCK2O43639 380 aa22.91■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 MMEP08473 750 aa22.91■■□□□ 1.26
SPHK1-202ENST00000392496 STAG3L1P0CL83 205 aa22.91■■□□□ 1.26
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