RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZFP28Q8NHY6 868 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC35B2Q8TB61 432 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 TTC17Q96AE7 1141 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 MIEF2Q96C03 454 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 TIFAQ96CG3 184 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC35A4Q96G79 324 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 LOXL4Q96JB6 756 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 DMRTA2Q96SC8 542 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 PACSIN1Q9BY11 444 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 WDCPQ9H6R7 721 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPON1Q9HCB6 807 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC23A1Q9UHI7 598 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 TCAF1Q9Y4C2 921 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 CAPN8A6NHC0 703 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 A6NNZ2 444 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 TBKBP1A7MCY6 615 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 H3BUI4 141 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 HAUS5O94927 633 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 AMHP03971 560 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 GNAI3P08754 354 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 TYRP14679 529 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 HK1P19367 917 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACO1P21399 889 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 MGAT1P26572 445 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 SELENOPP49908 381 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 CTSWP56202 376 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAB1AP62820 205 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 GNAI1P63096 354 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLP2Q04941 152 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 CRHR2Q13324 411 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 FZD5Q13467 585 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 SNAPC2Q13487 334 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 ICAM4Q14773 271 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 BMT2Q1RMZ1 405 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANO6Q4KMQ2 910 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 FLYWCH1Q4VC44 716 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 METTL24Q5JXM2 366 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 EFCAB12Q6NXP0 572 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC149Q6ZUS6 474 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 SH2D3CQ8N5H7 860 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR10H5Q8NGA6 315 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 CXorf38Q8TB03 319 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 Q8TCH9 128 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 MYOCQ99972 504 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRFN3Q9BTN0 628 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARMT1Q9H993 441 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 CNNM1Q9NRU3 951 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 PNPOQ9NVS9 261 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 POGKQ9P215 609 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 F2RL2O00254 374 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 TPP1O14773 563 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZBED1O96006 694 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 POMCP01189 267 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 ITGB1P05556 798 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 MYL1P05976 194 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 RHCEP18577 417 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 PIK3CGP48736 1102 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAN2A2P49641 1150 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 CACNB3P54284 484 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 USP14P54578 494 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM193AP78312 1265 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 PURAQ00577 322 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 RHDQ02161 417 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 FGL2Q14314 439 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 GALEQ14376 348 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLS1Q14651 629 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 LLGL1Q15334 1064 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 VPS72Q15906 364 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 NPNTQ6UXI9 565 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 KSR2Q6VAB6 950 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 AOPEPQ8N6M6 819 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 TTC9BQ8N6N2 239 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHST13Q8NET6 341 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLBD2Q8NHP8 589 aa3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.5 ms