RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249330.2

VGF-201, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGF, Length 2,575 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-201ENST00000249330 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa21.61■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 KRT13P13646 458 aa21.6■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 ICAM3P32942 547 aa21.6■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 KCTD2Q14681 263 aa21.6■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 LY6KQ17RY6 165 aa21.6■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 PIGWQ7Z7B1 504 aa21.6■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 LRRC34Q8IZ02 419 aa21.6■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 MMP19Q99542 508 aa21.6■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 STK33Q9BYT3 514 aa21.6■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 NOD2Q9HC29 1040 aa21.6■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 SLC12A4Q9UP95 1085 aa21.6■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa21.6■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 AGTP01019 485 aa21.6■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 DRG2P55039 364 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 PEX3P56589 373 aa21.6■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 ADCY2Q08462 1091 aa21.6■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 CCL15Q16663 113 aa21.6■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 C6orf118Q5T5N4 469 aa21.6■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 OLIG1Q8TAK6 271 aa21.6■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 ATP6V0A1Q93050 837 aa21.6■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 ADAM7Q9H2U9 754 aa21.6■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 NMRK2Q9NPI5 230 aa21.6■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 ANKEF1Q9NU02 776 aa21.6■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 TISP43B9A030 160 aa21.59■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 SOCS7O14512 581 aa21.59■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 PLS3P13797 630 aa21.59■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 ZDHHC24Q6UX98 284 aa21.59■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 FBXO25Q8TCJ0 367 aa21.59■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 BRI3BPQ8WY22 251 aa21.59■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 STRA6Q9BX79 667 aa21.59■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP21.59■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa21.59■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 PRKCEQ02156 737 aa21.59■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 FAM186BQ8IYM0 893 aa21.59■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 DNAJC12Q9UKB3 198 aa21.59■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 TRPC6Q9Y210 931 aa21.59■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa21.58■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 ARIH2O95376 493 aa21.58■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 VIMP08670 466 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa21.58■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 ATP4AP20648 1035 aa21.58■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 GBP1P32455 592 aa21.58■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 SLC29A2Q14542 456 aa21.58■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa21.58■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 KIFC3Q9BVG8 833 aa21.58■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
VGF-201ENST00000249330 SLC16A4O15374 487 aa21.58■■□□□ 1.04
VGF-201ENST00000249330 PHF2O75151 1096 aa21.58■■□□□ 1.04
VGF-201ENST00000249330 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
VGF-201ENST00000249330 TMEM63BQ5T3F8 832 aa21.58■■□□□ 1.04
VGF-201ENST00000249330 OTUD6AQ7L8S5 288 aa21.58■■□□□ 1.04
VGF-201ENST00000249330 FMNL3Q8IVF7 1028 aa21.58■■□□□ 1.04
VGF-201ENST00000249330 SYCP3Q8IZU3 236 aa21.58■■□□□ 1.04
VGF-201ENST00000249330 ARHGEF26Q96DR7 871 aa21.58■■□□□ 1.04
VGF-201ENST00000249330 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
VGF-201ENST00000249330 CCDC134Q9H6E4 229 aa21.58■■□□□ 1.04
VGF-201ENST00000249330 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa21.58■■□□□ 1.04
VGF-201ENST00000249330 PARP2Q9UGN5 583 aa21.58■■□□□ 1.04
VGF-201ENST00000249330 WDR81Q562E7 1941 aa21.58■■□□□ 1.04
VGF-201ENST00000249330 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa21.57■■□□□ 1.04
VGF-201ENST00000249330 CETPP11597 493 aa21.57■■□□□ 1.04
VGF-201ENST00000249330 HSPA6P17066 643 aa21.57■■□□□ 1.04
VGF-201ENST00000249330 TNFAIP3P21580 790 aa21.57■■□□□ 1.04
VGF-201ENST00000249330 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
VGF-201ENST00000249330 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP21.57■■□□□ 1.04
VGF-201ENST00000249330 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa21.57■■□□□ 1.04
VGF-201ENST00000249330 CFAP73A6NFT4 308 aa21.57■■□□□ 1.04
VGF-201ENST00000249330 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
VGF-201ENST00000249330 CYP2J2P51589 502 aa21.57■■□□□ 1.04
VGF-201ENST00000249330 CST9Q5W186 159 aa21.57■■□□□ 1.04
VGF-201ENST00000249330 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa21.57■■□□□ 1.04
VGF-201ENST00000249330 C2orf69Q8N8R5 385 aa21.57■■□□□ 1.04
VGF-201ENST00000249330 MIEF2Q96C03 454 aa21.57■■□□□ 1.04
VGF-201ENST00000249330 BORCS6Q96GS4 357 aa21.57■■□□□ 1.04
VGF-201ENST00000249330 CHRNA3P32297 505 aa21.56■■□□□ 1.04
VGF-201ENST00000249330 GTF2A2P52657 109 aa21.56■■□□□ 1.04
VGF-201ENST00000249330 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
VGF-201ENST00000249330 HAUS6Q7Z4H7 955 aa21.56■■□□□ 1.04
VGF-201ENST00000249330 RDH13Q8NBN7 331 aa21.56■■□□□ 1.04
VGF-201ENST00000249330 TCP11Q8WWU5 503 aa21.56■■□□□ 1.04
VGF-201ENST00000249330 ALG3Q92685 438 aa21.56■■□□□ 1.04
VGF-201ENST00000249330 C18orf8Q96DM3 657 aa21.56■■□□□ 1.04
VGF-201ENST00000249330 SYT11Q9BT88 431 aa21.56■■□□□ 1.04
VGF-201ENST00000249330 THAP2Q9H0W7 228 aa21.56■■□□□ 1.04
VGF-201ENST00000249330 MROH8Q9H579 483 aa21.56■■□□□ 1.04
VGF-201ENST00000249330 GRHL1Q9NZI5 618 aa21.56■■□□□ 1.04
VGF-201ENST00000249330 PNMA3Q9UL41 463 aa21.56■■□□□ 1.04
VGF-201ENST00000249330 ATG7O95352 703 aa21.56■■□□□ 1.04
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