RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640634.1

SCARB2-222, Transcript of scavenger receptor class B member 2, human

TSL 5

Gene SCARB2, Length 1,734 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCARB2-222	ENST00000640634	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	SMC2	O95347	1197 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	EOMES	O95936	686 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	GRM5	P41594	1212 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	PRCP	P42785	496 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	11.94	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	ALCAM	Q13740	583 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	TIFA	Q96CG3	184 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	GSDMA	Q96QA5	445 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	INSL6	Q9Y581	213 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	RFXAP	O00287	272 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	DDHD2	O94830	711 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	CSPG5	O95196	566 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	VAMP1	P23763	118 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	CYP2J2	P51589	502 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	PSMD2	Q13200	908 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	MORC3	Q14149	939 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	ABI1	Q8IZP0	508 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	PGBD4	Q96DM1	585 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	CWH43	Q9H720	699 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	TRIP11	Q15643	1979 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	OGT	O15294	1046 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	SKI	P12755	728 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	PTMS	P20962	102 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	RAB30	Q15771	203 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	SNX27	Q96L92	541 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	TMEM206	Q9H813	350 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	RMND1	Q9NWS8	449 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	MSRA	Q9UJ68	235 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	UBE4B	O95155	1302 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	ANK1	P16157	1881 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	DPYSL4	O14531	572 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	11.91	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	ADRB2	P07550	413 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	SCP2	P22307	547 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	GUCY2F	P51841	1108 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	NAB2	Q15742	525 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	LRRC43	Q8N309	656 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	FIBCD1	Q8N539	461 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	RDH13	Q8NBN7	331 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	COL6A3	P12111	3177 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SCARB2-222	ENST00000640634	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		11.91	□□□□□ -0.5

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