RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637239.2

TCF4-285, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 7,771 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-285	ENST00000637239	EXT2	Q93063	718 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	TRIM4	Q9C037	500 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	SIK2	Q9H0K1	926 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	HIST1H2AG	P0C0S8	130 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	SLC2A3	P11169	496 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	HIST1H2AD	P20671	130 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	SLC8A1	P32418	973 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	PRAME	P78395	509 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	LRRC63	Q05C16	580 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	NYAP2	Q9P242	653 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	RGS12	O14924	1447 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	RPTOR	Q8N122	1335 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	LRRD1	A4D1F6	860 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	ENC1	O14682	589 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	CAMTA2	O94983	1202 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	SMARCA1	P28370	1054 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	MXD3	Q9BW11	206 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	TLL1	O43897	1013 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	DGAT1	O75907	488 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	CAPZA2	P47755	286 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	IL9R	Q01113	521 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	SGCG	Q13326	291 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	CEP55	Q53EZ4	464 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	PLCG1	P19174	1290 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	C2orf54	Q08AI8	447 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	GLMN	Q92990	594 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	ADGRB2	O60241	1585 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	C3	P01024	1663 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	ZNF263	O14978	683 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	ARIH2	O95376	493 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	LRRC41	Q15345	812 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	ZNF280D	Q6N043	979 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	FIBCD1	Q8N539	461 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	ABHD8	Q96I13	439 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	TBK1	Q9UHD2	729 aa		6.97	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	NDUFB5	O43674	189 aa		6.96	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	GFPT2	O94808	682 aa		6.96	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		6.96	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	MEI4	A8MW99	385 aa		6.96	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	PFDN1	O60925	122 aa		6.96	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	SUN1	O94901	812 aa		6.96	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	POMC	P01189	267 aa		6.96	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	GNA15	P30679	374 aa		6.96	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	PPIL2	Q13356	520 aa		6.96	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		6.96	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	RDM1	Q8NG50	284 aa		6.96	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	CDCA5	Q96FF9	252 aa		6.96	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	KIF2C	Q99661	725 aa		6.96	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.29
TCF4-285	ENST00000637239	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3

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