RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564123.6

BBS2-208, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, human

TSL 3

Gene BBS2, Length 395 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS2-208	ENST00000564123	OBP2A	Q9NY56	170 aa		4.21	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	ZMYM3	Q14202	1370 aa		4.2	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		4.2	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		4.2	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	KIF3B	O15066	747 aa		4.2	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	ERC2	O15083	957 aa		4.2	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	GPR32	O75388	356 aa		4.2	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	STC2	O76061	302 aa		4.2	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	RAP2A	P10114	183 aa		4.2	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	FPR1	P21462	350 aa		4.2	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	CRHR1	P34998	444 aa		4.2	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	EPHB4	P54760	987 aa		4.2	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	TBX4	P57082	545 aa		4.2	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	CDC42EP1	Q00587	391 aa		4.2	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	APBA1	Q02410	837 aa		4.2	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	GRM3	Q14832	879 aa		4.2	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		4.2	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	DENND1C	Q8IV53	801 aa		4.2	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	GPR135	Q8IZ08	494 aa		4.2	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	PRR18	Q8N4B5	295 aa		4.2	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	RUNDC1	Q96C34	613 aa		4.2	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	TIFA	Q96CG3	184 aa		4.2	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	IL17RA	Q96F46	866 aa		4.2	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		4.2	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	TCF25	Q9BQ70	676 aa		4.2	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		4.2	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		4.2	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		4.2	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	TMEM140	Q9NV12	185 aa		4.2	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		4.2	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		4.2	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	PATE3	B3GLJ2	98 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	MUSK	O15146	869 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	SGTA	O43765	313 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	GAST	P01350	101 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	AMY1A	P04745	511 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	ALDH2	P05091	517 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	PCSK1	P29120	753 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	GNAL	P38405	381 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	GZMK	P49863	264 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	MAP2K6	P52564	334 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	DSC2	Q02487	901 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	SLFN13	Q68D06	897 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	USP51	Q70EK9	711 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	TTC7B	Q86TV6	843 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	CEP95	Q96GE4	821 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	WNT10B	O00744	389 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	PLSCR1	O15162	318 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	FOXS1	O43638	330 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	UBXN7	O94888	489 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	DDC	P20711	480 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	GUCY1A2	P33402	732 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	ALDH1A3	P47895	512 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	FLT3LG	P49771	235 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	GRM7	Q14831	915 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	LLGL1	Q15334	1064 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	AFMID	Q63HM1	303 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	DGKH	Q86XP1	1220 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	XYLT1	Q86Y38	959 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	CGRRF1	Q99675	332 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123		A6NNZ2	444 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123		H3BML4	177 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	B3GALT2	O43825	422 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	IL2RB	P14784	551 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	TGM1	P22735	817 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	HTR1B	P28222	390 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-208	ENST00000564123	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms