RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559494.1

TSPAN3-207, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TSPAN3, Length 1,326 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-207ENST00000559494 GARTP22102 1010 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 ACOT2P49753 483 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 GRIK3Q13003 919 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 NAB2Q15742 525 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 GLRA4Q5JXX5 417 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 SLC39A11Q8N1S5 342 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 SNX27Q96L92 541 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 CBWD1Q9BRT8 395 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 SPG21Q9NZD8 308 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 UBE4BO95155 1302 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 FGF18O76093 207 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 CXCL8P10145 99 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 IGFBP4P22692 258 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 KYAT1Q16773 422 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 GSDMAQ96QA5 445 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 TMEM175Q9BSA9 504 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 PCIF1Q9H4Z3 704 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 FAN1Q9Y2M0 1017 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 TTC26A0AVF1 554 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 LACTBL1A8MY62 500 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 NRP1O14786 923 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 SMC2O95347 1197 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 ADRB2P07550 413 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 KCNE1P15382 129 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 DNAJB1P25685 340 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 PLCB3Q01970 1234 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 CAMK1Q14012 370 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 SMARCE1Q969G3 411 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 CNTN3Q9P232 1028 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 CACNG4Q9UBN1 327 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 MTCH2Q9Y6C9 303 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 CLIC2O15247 247 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 FOSL2P15408 326 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 OR1G1P47890 313 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 TUSC3Q13454 348 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 ARMCX5Q6P1M9 558 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 RABGGTAQ92696 567 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 SAAL1Q96ER3 474 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 IGSF21Q96ID5 467 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 GOLGA8IPA6NC78 632 aa22.08■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 GOLGA8JA6NMD2 632 aa22.08■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 PPM1AP35813 382 aa22.08■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 POF1BQ8WVV4 589 aa22.08■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 PAAF1Q9BRP4 392 aa22.08■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 FAM213AQ9BRX8 229 aa22.08■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 KCTD10Q9H3F6 313 aa22.08■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 RMND1Q9NWS8 449 aa22.08■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 LMCD1Q9NZU5 365 aa22.08■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
TSPAN3-207ENST00000559494 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
TSPAN3-207ENST00000559494 CASTOR2A6NHX0 329 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPAN3-207ENST00000559494 F8W810 466 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPAN3-207ENST00000559494 LDHAP00338 332 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
TSPAN3-207ENST00000559494 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
TSPAN3-207ENST00000559494 KRT17Q04695 432 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPAN3-207ENST00000559494 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
TSPAN3-207ENST00000559494 SPAG1Q07617 926 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPAN3-207ENST00000559494 CAMK4Q16566 473 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPAN3-207ENST00000559494 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
TSPAN3-207ENST00000559494 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
TSPAN3-207ENST00000559494 FAM212AQ96EL1 285 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPAN3-207ENST00000559494 LMAN2LQ9H0V9 348 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPAN3-207ENST00000559494 MARCH5Q9NX47 278 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPAN3-207ENST00000559494 HSPBP1Q9NZL4 362 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPAN3-207ENST00000559494 MAN1B1Q9UKM7 699 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPAN3-207ENST00000559494 CARNS1A5YM72 827 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN3-207ENST00000559494 EXTL3O43909 919 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN3-207ENST00000559494 UBE3AQ05086 875 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN3-207ENST00000559494 ZBTB6Q15916 424 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN3-207ENST00000559494 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
TSPAN3-207ENST00000559494 ISM2Q6H9L7 571 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN3-207ENST00000559494 HS2ST1Q7LGA3 356 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN3-207ENST00000559494 C12orf56Q8IXR9 622 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN3-207ENST00000559494 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
TSPAN3-207ENST00000559494 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
TSPAN3-207ENST00000559494 TMEM169Q96HH4 297 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN3-207ENST00000559494 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN3-207ENST00000559494 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
TSPAN3-207ENST00000559494 LZTS1Q9Y250 596 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN3-207ENST00000559494 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN3-207ENST00000559494 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms