RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 RHOBTB3O94955 611 aa20.58■□□□□ 0.89
RABGGTA-208ENST00000558954 GALTP07902 379 aa20.58■□□□□ 0.89
RABGGTA-208ENST00000558954 CXCL8P10145 99 aa20.58■□□□□ 0.89
RABGGTA-208ENST00000558954 GARTP22102 1010 aa20.58■□□□□ 0.89
RABGGTA-208ENST00000558954 PLCB3Q01970 1234 aa20.58■□□□□ 0.89
RABGGTA-208ENST00000558954 KRT17Q04695 432 aa20.58■□□□□ 0.89
RABGGTA-208ENST00000558954 TUSC3Q13454 348 aa20.58■□□□□ 0.89
RABGGTA-208ENST00000558954 PNOCQ13519 176 aa20.58■□□□□ 0.89
RABGGTA-208ENST00000558954 KCNB1Q14721 858 aa20.58■□□□□ 0.89
RABGGTA-208ENST00000558954 BMT2Q1RMZ1 405 aa20.58■□□□□ 0.89
RABGGTA-208ENST00000558954 SEZ6Q53EL9 994 aa20.58■□□□□ 0.89
RABGGTA-208ENST00000558954 GLRA4Q5JXX5 417 aa20.58■□□□□ 0.89
RABGGTA-208ENST00000558954 SPPL3Q8TCT6 385 aa20.58■□□□□ 0.89
RABGGTA-208ENST00000558954 SCFD1Q8WVM8 642 aa20.58■□□□□ 0.89
RABGGTA-208ENST00000558954 IKZF4Q9H2S9 585 aa20.58■□□□□ 0.89
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC38A7Q9NVC3 462 aa20.58■□□□□ 0.89
RABGGTA-208ENST00000558954 CNTN3Q9P232 1028 aa20.58■□□□□ 0.89
RABGGTA-208ENST00000558954 LZTS1Q9Y250 596 aa20.58■□□□□ 0.89
RABGGTA-208ENST00000558954 MTCH2Q9Y6C9 303 aa20.58■□□□□ 0.89
RABGGTA-208ENST00000558954 ADSSP30520 456 aa20.57■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 TNFSF9P41273 254 aa20.57■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 PPP2R3AQ06190 1150 aa20.57■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 TIGD5Q53EQ6 642 aa20.57■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 XKR4Q5GH76 650 aa20.57■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 ARMCX5Q6P1M9 558 aa20.57■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 ALKAL1Q6UXT8 129 aa20.57■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 KIAA0895Q8NCT3 520 aa20.57■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 POF1BQ8WVV4 589 aa20.57■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 IGSF21Q96ID5 467 aa20.57■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa20.57■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 TLR9Q9NR96 1032 aa20.57■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 RMND1Q9NWS8 449 aa20.57■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 FAN1Q9Y2M0 1017 aa20.57■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa20.56■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa20.56■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 SMC2O95347 1197 aa20.56■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 ALDH2P05091 517 aa20.56■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 KCNE1P15382 129 aa20.56■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 HOXD13P35453 343 aa20.56■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 OR1G1P47890 313 aa20.56■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 STK4Q13043 487 aa20.56■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC10A6Q3KNW5 377 aa20.56■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa20.56■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 HS2ST1Q7LGA3 356 aa20.56■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 NELFCDQ8IXH7 590 aa20.56■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 CXCL16Q9H2A7 254 aa20.56■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 REV3LO60673 3130 aa20.56■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 TTC26A0AVF1 554 aa20.55■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 NRP1O14786 923 aa20.55■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 KIF20AO95235 890 aa20.55■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 ACOT2P49753 483 aa20.55■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 NAB2Q15742 525 aa20.55■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 MICALL1Q8N3F8 863 aa20.55■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 GSDMAQ96QA5 445 aa20.55■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 CBWD1Q9BRT8 395 aa20.55■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 STK39Q9UEW8 545 aa20.55■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 SCN1AP35498 2009 aa20.54■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 EYSQ5T1H1 3165 aa20.54■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 COL6A3P12111 3177 aa20.54■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 CASTOR2A6NHX0 329 aa20.54■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 GOLGA6L22H0YM25 854 aa20.54■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 CSPG5O95196 566 aa20.54■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 LDHAP00338 332 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 DNAJB1P25685 340 aa20.54■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 CD302Q8IX05 232 aa20.54■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 GOLGA5Q8TBA6 731 aa20.54■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 SMARCE1Q969G3 411 aa20.54■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 UROC1Q96N76 676 aa20.54■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 TSPAN18Q96SJ8 248 aa20.54■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 COLEC11Q9BWP8 271 aa20.54■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 CAMK1Q14012 370 aa20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 PPP2R3CQ969Q6 453 aa20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 SAAL1Q96ER3 474 aa20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM213AQ9BRX8 229 aa20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa20.53■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 MARCH5Q9NX47 278 aa20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms