RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	CLIC6	Q96NY7	704 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	NT5C1B	Q96P26	610 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	ADI1	Q9BV57	179 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	BTBD2	Q9BX70	525 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	CYR61	O00622	381 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	SLPI	P03973	132 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	SETSIP	P0DME0	302 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	PIK3CB	P42338	1070 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	MGAT2	Q10469	447 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	NFATC3	Q12968	1075 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	STK3	Q13188	491 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	KRT78	Q8N1N4	520 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	HDAC10	Q969S8	669 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	PGBD4	Q96DM1	585 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC138	Q96M89	665 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF747	Q9BV97	191 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	CEP170	Q5SW79	1584 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	CUTA	O60888	179 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM127	O75204	238 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	FGA	P02671	866 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	GLRB	P48167	497 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	PRIM2	P49643	509 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	CACNB3	P54284	484 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	CD83	Q01151	205 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	MGAT5	Q09328	741 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	NOMO1	Q15155	1222 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	APOA5	Q6Q788	366 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	DAAM2	Q86T65	1068 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	RGMA	Q96B86	450 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	WRNIP1	Q96S55	665 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM209	Q96SK2	561 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	MRI	Q9BWK5	157 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	CROT	Q9UKG9	612 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	MAPKBP1	O60336	1514 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	GRIN2A	Q12879	1464 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A088AWK7	358 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	CFAP69	A5D8W1	941 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	PATE3	B3GLJ2	98 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	RASA4B	C9J798	803 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	RASA4	O43374	803 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	PIP5K1C	O60331	668 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	FZD7	O75084	574 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	MYF5	P13349	255 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	IL12RB1	P42701	662 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	RAB1A	P62820	205 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	KRT72	Q14CN4	511 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	ANO1	Q5XXA6	986 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	SLFN13	Q68D06	897 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	GPR156	Q8NFN8	814 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	POF1B	Q8WVV4	589 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	RAB24	Q969Q5	203 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	VPS11	Q9H270	941 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	DEF6	Q9H4E7	631 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	ARMT1	Q9H993	441 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	JADE2	Q9NQC1	790 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	DLL4	Q9NR61	685 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SNHG1-222	ENST00000545308	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6

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