RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542232.6

RIMKLB-211, Transcript of ribosomal modification protein rimK like family member B, humanhuman

TSL 3

Gene RIMKLB, Length 640 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLB-211ENST00000542232 ASH2LQ9UBL3 628 aa10.03□□□□□ -0.8
RIMKLB-211ENST00000542232 CEP350Q5VT06 3117 aa10.02□□□□□ -0.8
RIMKLB-211ENST00000542232 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 AMHP03971 560 aa10.02□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 RASA3Q14644 834 aa10.02□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 C20orf194Q5TEA3 1177 aa10.02□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 CERS3Q8IU89 383 aa10.02□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 RAI14Q9P0K7 980 aa10.02□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 HMG20BQ9P0W2 317 aa10.02□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 ADAM29Q9UKF5 820 aa10.02□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 DOCK2Q92608 1830 aa10.02□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 TCP10L2B9ZVM9 353 aa10.01□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 GRIA2P42262 883 aa10.01□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 MCAMP43121 646 aa10.01□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 SELENOPP49908 381 aa10.01□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 PHF19Q5T6S3 580 aa10.01□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 GPATCH3Q96I76 525 aa10.01□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 LRRCC1Q9C099 1032 aa10.01□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 AK9Q5TCS8 1911 aa10.01□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 AKAP11Q9UKA4 1901 aa10.01□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa10.01□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 GAKO14976 1311 aa10.01□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 FZD7O75084 574 aa10□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 KLHL18O94889 574 aa10□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 BAG3O95817 575 aa10□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 MECOMQ03112 1051 aa10□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa10□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 JAM3Q9BX67 310 aa10□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 CCSER2Q9H7U1 834 aa10□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa10□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 OTOFQ9HC10 1997 aa10□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 LAMB1P07942 1786 aa10□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 ZNF623O75123 536 aa9.99□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 DDAH1O94760 285 aa9.99□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 BTDP43251 543 aa9.99□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 SREBF2Q12772 1141 aa9.99□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 DLK2Q6UY11 383 aa9.99□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 RASAL3Q86YV0 1011 aa9.99□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 DTX3Q8N9I9 347 aa9.99□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa9.99□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 Q8TCH9 128 aa9.99□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 CLEC4DQ8WXI8 215 aa9.99□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa9.99□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 SLC6A20Q9NP91 592 aa9.99□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 TCAF1Q9Y4C2 921 aa9.99□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 SSC5DA1L4H1 1573 aa9.99□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 SLC27A2O14975 620 aa9.98□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 MAFKO60675 156 aa9.98□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 MSCO60682 206 aa9.98□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 ENTPD3O75355 529 aa9.98□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 MAP3K12Q12852 859 aa9.98□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 PRKG1Q13976 671 aa9.98□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 SPDYAQ5MJ70 313 aa9.98□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa9.98□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 FAM151AQ8WW52 585 aa9.98□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 TMEM39BQ9GZU3 492 aa9.98□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 SAGE1Q9NXZ1 904 aa9.98□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa9.97□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 UBE2Q2LH0YL09 131 aa9.97□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 KRIT1O00522 736 aa9.97□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 MUSKO15146 869 aa9.97□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 IDH1O75874 414 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 CACNB3P54284 484 aa9.97□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 GRIN1Q05586 938 aa9.97□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 IDI2Q9BXS1 227 aa9.97□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 ZNF341Q9BYN7 854 aa9.97□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 DLL4Q9NR61 685 aa9.97□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 PRKAG3Q9UGI9 489 aa9.97□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 FOCADQ5VW36 1801 aa9.97□□□□□ -0.81
RIMKLB-211ENST00000542232 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
RIMKLB-211ENST00000542232 OVOL3O00110 214 aa9.96□□□□□ -0.82
RIMKLB-211ENST00000542232 ETFBP38117 255 aa9.96□□□□□ -0.82
RIMKLB-211ENST00000542232 INHBEP58166 350 aa9.96□□□□□ -0.82
RIMKLB-211ENST00000542232 TCP10Q12799 353 aa9.96□□□□□ -0.82
RIMKLB-211ENST00000542232 MAP4K2Q12851 820 aa9.96□□□□□ -0.82
RIMKLB-211ENST00000542232 VASNQ6EMK4 673 aa9.96□□□□□ -0.82
RIMKLB-211ENST00000542232 Q6ZUG5 572 aa9.96□□□□□ -0.82
RIMKLB-211ENST00000542232 MOB2Q70IA6 237 aa9.96□□□□□ -0.82
RIMKLB-211ENST00000542232 TRIM48Q8IWZ4 208 aa9.96□□□□□ -0.82
RIMKLB-211ENST00000542232 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
RIMKLB-211ENST00000542232 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP9.96□□□□□ -0.82
RIMKLB-211ENST00000542232 DCTPP1Q9H773 170 aa9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms