RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 UBXN11Q5T124 520 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 DOK3Q7L591 496 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 FEZF2Q8TBJ5 459 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP7.05□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 DUSP10Q9Y6W6 482 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 ATRNL1Q5VV63 1379 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 CAPN8A6NHC0 703 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 RHCEP18577 417 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 USP14P54578 494 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 RHDQ02161 417 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 DUSP8Q13202 625 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 GRM7Q14831 915 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 METTL24Q5JXM2 366 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 DACT2Q5SW24 774 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 FKBP15Q5T1M5 1219 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 AFMIDQ63HM1 303 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 CYB5RLQ6IPT4 315 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 KSR2Q6VAB6 950 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 SEM1Q6ZVN7 128 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM83AQ86UY5 434 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 PLXDC1Q8IUK5 500 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 TIFAQ96CG3 184 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 TEPSINQ96N21 525 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 XYLT2Q9H1B5 865 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 PARD6AQ9NPB6 346 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 PNPOQ9NVS9 261 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 L1RE1Q9UN81 338 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 HDAC5Q9UQL6 1122 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 ACTL7AQ9Y615 435 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 TPP1O14773 563 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 MFAP3LO75121 409 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 RAD17O75943 681 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 IPO13O94829 963 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 RAP2AP10114 183 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 ATP5JP18859 108 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 GNAT2P19087 354 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 PCSK1P29120 753 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 FGL2Q14314 439 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 MFSD14BQ5SR56 506 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 GLB1LQ6UWU2 654 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 NPNTQ6UXI9 565 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 LCNL1Q6ZST4 164 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 CCDC149Q6ZUS6 474 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 PJA1Q8NG27 643 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 STON2Q8WXE9 905 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 RAB24Q969Q5 203 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 LRFN3Q9BTN0 628 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 B3GNT5Q9BYG0 378 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 PLA2G3Q9NZ20 509 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 ZMYM3Q14202 1370 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-205ENST00000462042 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 H3BUI4 141 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 TYRP14679 529 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 FPR1P21462 350 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 ALDH1A3P47895 512 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 CLRN1P58418 232 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 SNAPC2Q13487 334 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 MAP9Q49MG5 647 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 POLNQ7Z5Q5 900 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 ZFP28Q8NHY6 868 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC35A4Q96G79 324 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 CEP95Q96GE4 821 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 OR14A2Q96R54 314 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 POLR3GLQ9BT43 218 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 MRI1Q9BV20 369 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF700Q9H0M5 742 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 KCNH6Q9H252 994 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 CNNM1Q9NRU3 951 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 ABCF2Q9UG63 623 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 ANO9A1A5B4 782 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 TBKBP1A7MCY6 615 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 GOLIM4O00461 696 aa7.01□□□□□ -1.29
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