RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427658.1

AFG3L1P-208, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, human

TSL 2

Gene AFG3L1P, Length 2,758 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		11.14	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		11.14	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM187A	A6NFU0	413 aa		11.13	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PP2D1	A8MPX8	630 aa		11.13	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FBP2	O00757	339 aa		11.13	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GYS1	P13807	737 aa		11.13	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	COG7	P83436	770 aa		11.13	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		11.13	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		11.13	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC25	Q86WR0	208 aa		11.13	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	VPS52	Q8N1B4	723 aa		11.13	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FANCB	Q8NB91	859 aa		11.13	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C10orf82	Q8WW14	230 aa		11.13	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		11.13	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM89A	Q96GI7	184 aa		11.13	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NAPB	Q9H115	298 aa		11.13	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		11.13	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		11.13	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MYPN	Q86TC9	1320 aa		11.13	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ADCY3	O60266	1144 aa		11.13	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PDE8A	O60658	829 aa		11.13	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ACSL3	O95573	720 aa		11.13	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IL9R	Q01113	521 aa		11.13	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SCARF1	Q14162	830 aa		11.13	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LRRC15	Q8TF66	581 aa		11.13	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TNFRSF25	Q93038	417 aa		11.13	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		11.13	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		11.13	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		11.13	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CEP72	Q9P209	647 aa		11.13	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		11.13	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		11.13	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TM4SF1	P30408	202 aa		11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CTSW	P56202	376 aa		11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NAA20	P61599	178 aa		11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MAPK7	Q13164	816 aa		11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MED21	Q13503	144 aa		11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRIM11	Q96F44	468 aa		11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TTC1	Q99614	292 aa		11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NYX	Q9GZU5	481 aa		11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GPR108	Q9NPR9	543 aa		11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TIMM22	Q9Y584	194 aa		11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MAGEB2	O15479	319 aa		11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ADAM23	O75077	832 aa		11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BAG2	O95816	211 aa		11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TFAP2A	P05549	437 aa		11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ATP5D	P30049	168 aa		11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NEK2	P51955	445 aa		11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CAMK2B	Q13554	666 aa		11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LRRC24	Q50LG9	513 aa		11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KSR1	Q8IVT5	923 aa		11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HES6	Q96HZ4	224 aa		11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TBK1	Q9UHD2	729 aa		11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	STX8	Q9UNK0	236 aa		11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		11.12	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	STRN	O43815	780 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GAS8	O95995	478 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZAP70	P43403	619 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NPY5R	Q15761	445 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C6orf183	Q5T699	404 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CENPP	Q6IPU0	288 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NEPRO	Q6NW34	567 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RASSF3	Q86WH2	238 aa		11.11	□□□□□ -0.63

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