RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HS2ST1Q7LGA3 356 aa16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF280BQ86YH2 543 aa16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CD302Q8IX05 232 aa16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 COLGALT2Q8IYK4 626 aa16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC39A11Q8N1S5 342 aa16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GOLGA5Q8TBA6 731 aa16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GDPD5Q8WTR4 605 aa16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SCFD1Q8WVM8 642 aa16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 POMGNT1Q8WZA1 660 aa16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HPS3Q969F9 1004 aa16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HAPLN2Q9GZV7 340 aa16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC39A2Q9NP94 309 aa16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KLK14Q9P0G3 267 aa16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HCSTQ9UBK5 93 aa16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TTC3P53804 2025 aa16.68■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EVPLQ92817 2033 aa16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GOLGA6L22H0YM25 854 aa16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PTGESO14684 152 aa16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DDHD2O94830 711 aa16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ITGB1P05556 798 aa16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADRB2P07550 413 aa16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADSSP30520 456 aa16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OSTNP61366 133 aa16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 STK4Q13043 487 aa16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPATA20Q8TB22 786 aa16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPPL3Q8TCT6 385 aa16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM169Q96HH4 297 aa16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MIOSQ9NXC5 875 aa16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAN1Q9Y2M0 1017 aa16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MTCH2Q9Y6C9 303 aa16.67■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TTC26A0AVF1 554 aa16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RFXAPO00287 272 aa16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGFBP4P22692 258 aa16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC11A1P49279 550 aa16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPP2R3AQ06190 1150 aa16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC10A6Q3KNW5 377 aa16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TIGD5Q53EQ6 642 aa16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARMCX5Q6P1M9 558 aa16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KIAA0895Q8NCT3 520 aa16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GLIS3Q8NEA6 775 aa16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM174Q8WUU8 243 aa16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGSF21Q96ID5 467 aa16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UROC1Q96N76 676 aa16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 COLEC11Q9BWP8 271 aa16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ASB7Q9H672 318 aa16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KIAA1586Q9HCI6 787 aa16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DNAJB4Q9UDY4 337 aa16.66■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NRP1O14786 923 aa16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GRM6O15303 877 aa16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 XPOTO43592 962 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HOXD13P35453 343 aa16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR1G1P47890 313 aa16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PNOCQ13519 176 aa16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NAB2Q15742 525 aa16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C12orf56Q8IXR9 622 aa16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 POF1BQ8WVV4 589 aa16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SMARCE1Q969G3 411 aa16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DERAQ9Y315 318 aa16.65■□□□□ 0.26
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TISP43B9A030 160 aa16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TGFB1I1O43294 461 aa16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EXTL3O43909 919 aa16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP2-201ENST00000398621 B4GALT3O60512 393 aa16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IL18RAPO95256 599 aa16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CXCL8P10145 99 aa16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PYGBP11216 843 aa16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PBX3P40426 434 aa16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SEZ6Q53EL9 994 aa16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP2-201ENST00000398621 COBLL1Q53SF7 1204 aa16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPP2R3CQ969Q6 453 aa16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CBWD1Q9BRT8 395 aa16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TLR9Q9NR96 1032 aa16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa16.64■□□□□ 0.25
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa16.63■□□□□ 0.25
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PDXKO00764 312 aa16.63■□□□□ 0.25
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CYP3A5P20815 502 aa16.63■□□□□ 0.25
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RPL9P32969 192 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPP1R2P41236 205 aa16.63■□□□□ 0.25
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TNFSF9P41273 254 aa16.63■□□□□ 0.25
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MYBPC2Q14324 1141 aa16.63■□□□□ 0.25
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GLRA4Q5JXX5 417 aa16.63■□□□□ 0.25
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NT5DC4Q86YG4 428 aa16.63■□□□□ 0.25
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NELFCDQ8IXH7 590 aa16.63■□□□□ 0.25
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GPD1LQ8N335 351 aa16.63■□□□□ 0.25
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms