RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380283.4

PXDC1-202, Transcript of PX domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PXDC1, Length 2,190 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1-202ENST00000380283 CLTAP09496 248 aa28.28■■■□□ 2.12
PXDC1-202ENST00000380283 RARAP10276 462 aa28.28■■■□□ 2.12
PXDC1-202ENST00000380283 NQO1P15559 274 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
PXDC1-202ENST00000380283 SCP2P22307 547 aa28.28■■■□□ 2.12
PXDC1-202ENST00000380283 COILP38432 576 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
PXDC1-202ENST00000380283 GPC5P78333 572 aa28.28■■■□□ 2.12
PXDC1-202ENST00000380283 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
PXDC1-202ENST00000380283 MAB21L3Q8N8X9 362 aa28.28■■■□□ 2.12
PXDC1-202ENST00000380283 ELP3Q9H9T3 547 aa28.28■■■□□ 2.12
PXDC1-202ENST00000380283 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa28.28■■■□□ 2.12
PXDC1-202ENST00000380283 FTLP02792 175 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
PXDC1-202ENST00000380283 CYP3A4P08684 503 aa28.28■■■□□ 2.12
PXDC1-202ENST00000380283 TRIM49P0CI25 452 aa28.28■■■□□ 2.12
PXDC1-202ENST00000380283 TRIM49CP0CI26 452 aa28.28■■■□□ 2.12
PXDC1-202ENST00000380283 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
PXDC1-202ENST00000380283 SLCO1A2P46721 670 aa28.28■■■□□ 2.12
PXDC1-202ENST00000380283 NCALDP61601 193 aa28.28■■■□□ 2.12
PXDC1-202ENST00000380283 ACCSLQ4AC99 568 aa28.28■■■□□ 2.12
PXDC1-202ENST00000380283 SLC9A9Q8IVB4 645 aa28.28■■■□□ 2.12
PXDC1-202ENST00000380283 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
PXDC1-202ENST00000380283 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
PXDC1-202ENST00000380283 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
PXDC1-202ENST00000380283 OTOFQ9HC10 1997 aa28.27■■■□□ 2.12
PXDC1-202ENST00000380283 UBOX5O94941 541 aa28.27■■■□□ 2.12
PXDC1-202ENST00000380283 BCRP11274 1271 aa28.27■■■□□ 2.12
PXDC1-202ENST00000380283 IFNAR2P48551 515 aa28.27■■■□□ 2.12
PXDC1-202ENST00000380283 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
PXDC1-202ENST00000380283 LDHDQ86WU2 507 aa28.27■■■□□ 2.12
PXDC1-202ENST00000380283 SLC20A1Q8WUM9 679 aa28.27■■■□□ 2.12
PXDC1-202ENST00000380283 TBC1D31Q96DN5 1066 aa28.27■■■□□ 2.12
PXDC1-202ENST00000380283 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
PXDC1-202ENST00000380283 BFSP1Q12934 665 aa28.27■■■□□ 2.12
PXDC1-202ENST00000380283 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
PXDC1-202ENST00000380283 SH3D19Q5HYK7 790 aa28.27■■■□□ 2.12
PXDC1-202ENST00000380283 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa28.27■■■□□ 2.12
PXDC1-202ENST00000380283 PASKQ96RG2 1323 aa28.27■■■□□ 2.12
PXDC1-202ENST00000380283 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa28.26■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 DCAF8L1A6NGE4 600 aa28.26■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 COMTP21964 271 aa28.26■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 PIGOQ8TEQ8 1089 aa28.26■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa28.26■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 SERPINB12Q96P63 405 aa28.26■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa28.26■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 MTUS1Q9ULD2 1270 aa28.26■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 ZNF536O15090 1300 aa28.26■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 ANKRD63C9JTQ0 380 aa28.26■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 LRRN2O75325 713 aa28.26■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 ICAM1P05362 532 aa28.26■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 CYP2J2P51589 502 aa28.26■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 ERO1BQ86YB8 467 aa28.26■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 AGBL1Q96MI9 1066 aa28.26■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 RTN2O75298 545 aa28.25■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 SLITRK3O94933 977 aa28.25■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 PYGMP11217 842 aa28.25■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 MYBPC2Q14324 1141 aa28.25■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 O00370 1275 aa28.24■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 SUN1O94901 812 aa28.24■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 BNIP1Q12981 228 aa28.24■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 CCDC105Q8IYK2 499 aa28.24■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 CYP2W1Q8TAV3 490 aa28.24■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 SLCO2A1Q92959 643 aa28.24■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 OTUD5Q96G74 571 aa28.24■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 PLCD4Q9BRC7 762 aa28.24■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 C15orf41Q9Y2V0 281 aa28.24■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 IRF6O14896 467 aa28.24■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 KSR1Q8IVT5 923 aa28.24■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 FAM178BQ8IXR5 827 aa28.24■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 CPXCR1Q8N123 301 aa28.24■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 ZNF408Q9H9D4 720 aa28.24■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 CCPG1Q9ULG6 757 aa28.24■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa28.23■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP28.23■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa28.23■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 OTOP1Q7RTM1 612 aa28.23■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 AGAP11Q8TF27 550 aa28.23■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 CCDC113Q9H0I3 377 aa28.23■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 LRRC19Q9H756 370 aa28.23■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 ECT2Q9H8V3 914 aa28.23■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 WHRNQ9P202 907 aa28.23■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa28.23■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 SPDYE5A6NIY4 337 aa28.23■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 GJB6O95452 261 aa28.23■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 GZMAP12544 262 aa28.23■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 MUTP22033 750 aa28.23■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 KCNJ2P63252 427 aa28.23■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 CCDC38Q502W7 563 aa28.23■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 NSMCE1Q8WV22 266 aa28.23■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 STRA6Q9BX79 667 aa28.23■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 NMRK2Q9NPI5 230 aa28.23■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 KCND2Q9NZV8 630 aa28.23■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 PIK3CDO00329 1044 aa28.22■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 VWA5AO00534 786 aa28.22■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 TP73O15350 636 aa28.22■■■□□ 2.11
PXDC1-202ENST00000380283 ANP32DO95626 131 aa28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms