RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 CLEC17AQ6ZS10 378 aa16.78■□□□□ 0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 CD302Q8IX05 232 aa16.78■□□□□ 0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 COLGALT2Q8IYK4 626 aa16.78■□□□□ 0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 MICALL1Q8N3F8 863 aa16.78■□□□□ 0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 CEP120Q8N960 986 aa16.78■□□□□ 0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF507Q8TCN5 953 aa16.78■□□□□ 0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 POF1BQ8WVV4 589 aa16.78■□□□□ 0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 HPS3Q969F9 1004 aa16.78■□□□□ 0.28
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PGGT1B-202ENST00000379615 SLC39A4Q6P5W5 647 aa16.77■□□□□ 0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 ALKAL1Q6UXT8 129 aa16.77■□□□□ 0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 HS2ST1Q7LGA3 356 aa16.77■□□□□ 0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa16.77■□□□□ 0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 IGSF21Q96ID5 467 aa16.77■□□□□ 0.28
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PGGT1B-202ENST00000379615 RMND1Q9NWS8 449 aa16.77■□□□□ 0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A0C4DFX4 3053 aa16.77■□□□□ 0.27
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PGGT1B-202ENST00000379615 NRP1O14786 923 aa16.76■□□□□ 0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 XPOTO43592 962 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
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PGGT1B-202ENST00000379615 SLC10A6Q3KNW5 377 aa16.76■□□□□ 0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 ARMCX5Q6P1M9 558 aa16.76■□□□□ 0.27
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PGGT1B-202ENST00000379615 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa16.76■□□□□ 0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 HAPLN2Q9GZV7 340 aa16.76■□□□□ 0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
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PGGT1B-202ENST00000379615 BRWD1Q9NSI6 2320 aa16.76■□□□□ 0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 CITO14578 2027 aa16.75■□□□□ 0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 GOLGA6L22H0YM25 854 aa16.75■□□□□ 0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 NCK2O43639 380 aa16.75■□□□□ 0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 RHOBTB3O94955 611 aa16.75■□□□□ 0.27
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PGGT1B-202ENST00000379615 ADSSP30520 456 aa16.75■□□□□ 0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 BMT2Q1RMZ1 405 aa16.75■□□□□ 0.27
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PGGT1B-202ENST00000379615 TMC7Q7Z402 723 aa16.75■□□□□ 0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 SCFD1Q8WVM8 642 aa16.75■□□□□ 0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 GSDMAQ96QA5 445 aa16.75■□□□□ 0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 KIAA1586Q9HCI6 787 aa16.75■□□□□ 0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa16.75■□□□□ 0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 TTC26A0AVF1 554 aa16.74■□□□□ 0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM189A1O60320 539 aa16.74■□□□□ 0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 TADA2AO75478 443 aa16.74■□□□□ 0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 PRR29P0C7W0 189 aa16.74■□□□□ 0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 ACOT2P49753 483 aa16.74■□□□□ 0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 STK4Q13043 487 aa16.74■□□□□ 0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 GLRA4Q5JXX5 417 aa16.74■□□□□ 0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 GLIS3Q8NEA6 775 aa16.74■□□□□ 0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 ASB7Q9H672 318 aa16.74■□□□□ 0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa16.74■□□□□ 0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa16.74■□□□□ 0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 KIAA1671Q9BY89 1806 aa16.73■□□□□ 0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 FSD2A1L4K1 749 aa16.73■□□□□ 0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 CASTOR2A6NHX0 329 aa16.73■□□□□ 0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 TISP43B9A030 160 aa16.73■□□□□ 0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 EXTL3O43909 919 aa16.73■□□□□ 0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 B4GALT3O60512 393 aa16.73■□□□□ 0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 IL18RAPO95256 599 aa16.73■□□□□ 0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 ADRB2P07550 413 aa16.73■□□□□ 0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 DNAJB1P25685 340 aa16.73■□□□□ 0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 RPL9P32969 192 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 TNFSF9P41273 254 aa16.73■□□□□ 0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 PNOCQ13519 176 aa16.73■□□□□ 0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 CAMK1Q14012 370 aa16.73■□□□□ 0.27
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