RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340994.4

PKHD1-201, Transcript of PKHD1, fibrocystin/polyductin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PKHD1, Length 11,589 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1-201ENST00000340994 GHRP10912 638 aa8.65□□□□□ -1.02
PKHD1-201ENST00000340994 KRT74Q7RTS7 529 aa8.65□□□□□ -1.02
PKHD1-201ENST00000340994 PPM1NQ8N819 430 aa8.65□□□□□ -1.02
PKHD1-201ENST00000340994 FAM81AQ8TBF8 368 aa8.65□□□□□ -1.02
PKHD1-201ENST00000340994 FAM45AQ8TCE6 357 aa8.65□□□□□ -1.02
PKHD1-201ENST00000340994 MANSC1Q9H8J5 431 aa8.65□□□□□ -1.02
PKHD1-201ENST00000340994 MAD2L2Q9UI95 211 aa8.65□□□□□ -1.02
PKHD1-201ENST00000340994 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa8.65□□□□□ -1.02
PKHD1-201ENST00000340994 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
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PKHD1-201ENST00000340994 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PKHD1-201ENST00000340994 KRT27Q7Z3Y8 459 aa8.65□□□□□ -1.02
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PKHD1-201ENST00000340994 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PKHD1-201ENST00000340994 VPS11Q9H270 941 aa8.65□□□□□ -1.02
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PKHD1-201ENST00000340994 JAK3P52333 1124 aa8.65□□□□□ -1.02
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PKHD1-201ENST00000340994 OTULINQ96BN8 352 aa8.65□□□□□ -1.02
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PKHD1-201ENST00000340994 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PKHD1-201ENST00000340994 ATP6V1B1P15313 513 aa8.65□□□□□ -1.03
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PKHD1-201ENST00000340994 SYTL2Q9HCH5 934 aa8.65□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa8.65□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 IL6P05231 212 aa8.65□□□□□ -1.03
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PKHD1-201ENST00000340994 FCHO2Q0JRZ9 810 aa8.65□□□□□ -1.03
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PKHD1-201ENST00000340994 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 PIGUQ9H490 435 aa8.65□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 COPRSQ9NQ92 184 aa8.65□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 SLC9A2Q9UBY0 812 aa8.65□□□□□ -1.03
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PKHD1-201ENST00000340994 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP8.65□□□□□ -1.03
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PKHD1-201ENST00000340994 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 PSTPIP1O43586 416 aa8.64□□□□□ -1.03
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PKHD1-201ENST00000340994 STAP1Q9ULZ2 295 aa8.64□□□□□ -1.03
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PKHD1-201ENST00000340994 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa8.64□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
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PKHD1-201ENST00000340994 APOL1O14791 398 aa8.64□□□□□ -1.03
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PKHD1-201ENST00000340994 SCP2P22307 547 aa8.64□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 JAK1P23458 1154 aa8.64□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 TGFBR2P37173 567 aa8.64□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 COG2Q14746 738 aa8.64□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 ARHGAP17Q68EM7 881 aa8.64□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 IYDQ6PHW0 289 aa8.64□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 PARD3BQ8TEW8 1205 aa8.64□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 SUCLG2Q96I99 432 aa8.64□□□□□ -1.03
PKHD1-201ENST00000340994 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
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