RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 POTEJP0CG39 1038 aa23.37■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 EPS15P42566 896 aa23.37■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 SPATA24Q86W54 205 aa23.37■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 VAV1P15498 845 aa23.36■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 TECP42680 631 aa23.36■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 SESN3P58005 492 aa23.36■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 GSTM4Q03013 218 aa23.36■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 GIT2Q14161 759 aa23.36■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 DENND2CQ68D51 928 aa23.36■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 BTNL9Q6UXG8 535 aa23.36■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 ECHDC2Q86YB7 292 aa23.36■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 PPFIBP2Q8ND30 876 aa23.36■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 NRG4Q8WWG1 115 aa23.36■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 INIPQ9NRY2 104 aa23.36■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 ZNF148Q9UQR1 794 aa23.36■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 USH1CQ9Y6N9 552 aa23.36■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 TMEM247A6NEH6 219 aa23.35■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 F5H6K3 240 aa23.35■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 ETS2P15036 469 aa23.35■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 CLK2P49760 499 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 KLRC3Q07444 240 aa23.35■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 QRICH1Q2TAL8 776 aa23.35■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 CDAN1Q8IWY9 1227 aa23.35■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 NME8Q8N427 588 aa23.35■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 ERMNQ8TAM6 284 aa23.35■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 MAML3Q96JK9 1138 aa23.35■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 DHRS1Q96LJ7 313 aa23.35■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 TLDC2A0PJX2 215 aa23.35■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 BIRC5O15392 142 aa23.35■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 TNNI2P48788 182 aa23.35■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 SNAP25P60880 206 aa23.35■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 AP1B1Q10567 949 aa23.35■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 TTI2Q6NXR4 508 aa23.35■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa23.35■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 TMEM110Q86TL2 294 aa23.35■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 DCAF4Q8WV16 495 aa23.35■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 GPRC5DQ9NZD1 345 aa23.35■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 A0A1W2PRG0 241 aa23.34■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 MIIPQ5JXC2 388 aa23.34■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 TCERG1LQ5VWI1 586 aa23.34■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 PPP1R18Q6NYC8 613 aa23.34■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 SCUBE1Q8IWY4 988 aa23.34■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 GRAMD1AQ96CP6 724 aa23.34■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 MTMR9Q96QG7 549 aa23.34■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 PASKQ96RG2 1323 aa23.34■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 TRIM43BA6NCK2 446 aa23.34■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP23.34■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 RASSF2P50749 326 aa23.34■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 OLFML2BQ68BL8 750 aa23.34■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 CABP7Q86V35 215 aa23.34■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 TRPM4Q8TD43 1214 aa23.34■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 MYLK2Q9H1R3 596 aa23.34■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 TLE6Q9H808 572 aa23.34■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 PSMA7O14818 248 aa23.33■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 NDUFB10O96000 172 aa23.33■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 HARSP12081 509 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 PLCG1P19174 1290 aa23.33■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 TXKP42681 527 aa23.33■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 PMS2P54278 862 aa23.33■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 ADARP55265 1226 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 SLC34A1Q06495 639 aa23.33■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 RPS6KA1Q15418 735 aa23.33■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 VSIG1Q86XK7 387 aa23.33■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 KCNK3O14649 394 aa23.33■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 CNTNAP1P78357 1384 aa23.33■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 SPDYE2Q495Y8 402 aa23.33■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 MIGA2Q7L4E1 593 aa23.33■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 CKAP2Q8WWK9 683 aa23.33■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 NACA2Q9H009 215 aa23.33■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 TBCCD1Q9NVR7 557 aa23.33■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 TMOD2Q9NZR1 351 aa23.33■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 USP17L15C9J2P7 530 aa23.32■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 USP17L13C9JLJ4 530 aa23.32■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 USP17L11C9JVI0 530 aa23.32■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 USP17L18D6R9N7 530 aa23.32■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 USP17L22D6RA61 530 aa23.32■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 USP17L17D6RBQ6 530 aa23.32■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 USP17L19D6RCP7 530 aa23.32■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 USP17L20D6RJB6 530 aa23.32■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 USP17L24Q0WX57 530 aa23.32■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 USP17L6PQ6QN14 398 aa23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 107.4 ms